首页 › 文章标签 "分子对接"
视频回放 | 用SPARK帮你突破现有技术设计的限制

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本视频演示了如何用SPARK进行骨架跃迁与分子生长以突破现有技术或知识产权的限制、获得具有独立知识产权的新化合物。还演示…
云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选

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VirtualFlow是一款开源的、基于结构的、超高通量虚拟筛选平台，Gorulla等人成功地用8000个核心花两周时间…
2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构

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由上海科技大学饶子和/杨海涛课题组测定的2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶体结构于2020年2…
真实世界的分子设计

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罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例，在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目，目的是凸显那些能够实际带…
关于用分子对接预测结合亲和力的问题

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人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽：对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…
认清虚拟筛选中的陷阱

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虚拟筛选的目的是利用蛋白质靶标或已知生物活性配体的相关信息通过计算的方法来识别具有活性的化合物。虚拟筛选有众多的参数设置…
Lead Finder 分子对接性能测试

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本文用CASF-2013数据集测试了Lead Finder的采样性能与打分性能。结果表明：重复进行3次计算，取打分最高前…
蛋白结构的检查与准备

蛋白结构的检查与准备

从PDB数据库下载的蛋白结构并不完美，正确准备与否影响了分子对接的结果。本文介绍了如何在分子对接前检查蛋白的结构，并加以…
Lead Finder教程 | 基于结构的虚拟筛选

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Lead Finder是一款分子对接软件，本文以TK激酶抑制剂的虚拟筛选为例，演示了如何用Lead Finder对化合物…
Flare 教程 | 分子对接-结合模式预测

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本教程演示了Flare的对接计算流程，包括：1）PDB文件下载；2）受体、配体结构准备；3）配体的导入；4）分子对接计算…

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