分子对接 Archives - 墨灵格的博客

用分子动力学模拟生成蛋白构象系综用于对接实验更具生物学合理性

对接是一种利用蛋白结构产生配体结合模式(pose)并对所产生的相互作用进行打分的方法。在药物发现中，该方法广泛用于筛选分…

原创文章
小墨
Cresset
2022-10-26
1,489
0

OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（…

小墨
OEDocking
2022-04-11
1,388
0

分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤

分子对接后处理可以提高分子对接虚拟筛选的性能。本文分享了如何用Flare的Python API来实现可视化分析的自动化处…

小墨
Cresset
2021-11-02
4,740
0

关于分子对接预测结合模式的问题

本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例，解释为什么分子对接并不是一件容易的事。

原创文章
小墨
Docking
2021-07-30
3,601
4

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

深度生成模型已用来进行从头分子设计，能够生成性质理想的化合物。然而，大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…

原创文章
小墨
案例
2021-07-21
2,055
0

基于结构药物发现中的决策：对接结果的手工检查

分子对接是一种广泛应用于药物发现的计算方法。由于分子对接固有的不精确性，结合模式的手工检查是计算药物化学家在决策过程中至…

原创文章
小墨
Docking
2021-05-22
3,012
7

网络研讨会 | 用SPARK帮你突破现有技术设计的限制（附视频回放）

本视频演示了如何用SPARK进行骨架跃迁与分子生长以突破现有技术或知识产权的限制、获得具有独立知识产权的新化合物。还演示…

原创文章
小墨
Cresset
2020-11-08
1,399
0

云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选

VirtualFlow是一款开源的、基于结构的、超高通量虚拟筛选平台，Gorulla等人成功地用8000个核心花两周时间…

原创文章
小墨
Docking
2020-07-20
6,949
8

2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构

由上海科技大学饶子和/杨海涛课题组测定的2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶体结构于2020年2…

原创文章
小墨
Cresset
2020-02-06
6,330
5

真实世界的分子设计

罗氏的科学家们分享了一系列小分子药物发现案例，在这些案例中计算方法前瞻性地影响了罗氏的研究项目，目的是凸显那些能够实际带…

原创文章
小墨
ligand-based
2020-01-23
4,998
10

用分子动力学模拟生成蛋白构象系综用于对接实验更具生物学合理性

OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤

关于分子对接预测结合模式的问题

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

基于结构药物发现中的决策：对接结果的手工检查

网络研讨会 | 用SPARK帮你突破现有技术设计的限制（附视频回放）

云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选

2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构

真实世界的分子设计

关注我们么么哒！

最新文章

使用Flare的组合库枚举器（Library enumerator）进行化学修饰

用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 M^pro 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究

Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果

选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁

加速发现新型靶向蛋白降解疗法

热门标签

友情链接

关注我们 么么哒！

最新文章

热门标签

友情链接

大家都在搜

微信公众号

关注我们么么哒！