药物化学设计的核心——Forge和Spark之间的协同关系

药物化学设计的核心——Forge和Spark之间的协同关系

我们展示了一个计算机辅助药物化学设计的练习：使用Activity Atlas1来评估和理解一组CDK2抑制剂的活性特征； ...
用Activity Atlas解决选择性问题

用Activity Atlas解决选择性问题

Activity Atlas1 是 Forge 2 中的一个模块，而Forge 是 Cresset 用于配体设计和 SA ...
将专利数据转化为SAR的3D图

将专利数据转化为SAR的3D图

Activity Atlas1是Forge2 中一种新颖的定性分析方法，而 Forge2 是 Cresset 用于配体设 ...
用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能

用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能

HPK1作为一种靶标，其特征在于结合口袋具有较高的构象柔性，并涉及到溶剂化作用的影响，这为使用自由能微扰（FEP）方法预 ...
用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序

用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序

生物等排体替换（Bioisostere replacement）是在药物发现中用于优化候选分子活性和选择性的一个强大且流 ...
优化π-π T-型相互作用

优化π-π T-型相互作用

本文综述了韩国浦项科技大学科学家们的研究，探讨了单取代芳基对π-π边对面或T-型相互作用的影响。 ...
二甲基膦酰基衍生物的细胞膜渗透性

二甲基膦酰基衍生物的细胞膜渗透性

文章讨论了二甲基膦酰基衍生物在药物化学中的细胞膜渗透性。膦酰基作为电子吸引基团，因其相对不亲脂的特性而受到关注。 ...
生成式分子设计并非看起来那么容易

生成式分子设计并非看起来那么容易

Pat Walters的这篇博客探讨了生成式 AI 在药物设计中的实际应用，尤其是针对媒体上关于《生成式 AI 将在不久 ...
开源软件ADMET-AI的介绍

开源软件ADMET-AI的介绍

目前已经有非常多的ADMET性质预测工具，包括商业软件、开源软件。 ...
使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

本文演示了如何利用Flare水分析工具3D-RISM用来分析大环抑制剂BRD-810与靶标的共晶结构、理解大环的结合模式 ...

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