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偏电荷（ partial charge）的计算

最新偏电荷（ partial charge）的计算

本文介绍了常见偏电荷（partial charge）的计算方法、区别与合适的应用场景。OpenEye的QUACPAC提供…
势能面——联系分子结构与能量的纽带

势能面——联系分子结构与能量的纽带

本文介绍了势能面与反应坐标的概念，以及势能面与结构、能量的关系。还讨论了结构、稳定性、反应性和选择性与能量之间的关系。
通过扭转角分析发现先导化合物优化的机会

通过扭转角分析发现先导化合物优化的机会

本文演示了如何用Flare QM的扭转角分析以发现高能的生物学构象并由此发现化合物优化的机会。具体地讲，以BMS Fac…
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计

从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计

本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。HRS1167的大环设计…
在计算中使用Hit Expander与QSAR进行新分子设计与打分

在计算中使用Hit Expander与QSAR进行新分子设计与打分

本文是前期在线视频研讨会的文字讲解，以BTK抑制剂为例，回顾了如何在CADD软件解决方案Flare中用XED力场和QSA…
用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化

用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化

子图分析是一种非常有价值的方法，可以提高FEP计算的精度和可靠性，增强其在计算药物发现中的适用性。本文以PTP1B靶标和…
用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计

用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计

本文介绍了Cresset自由能微扰计算解决方案Flare FEP让自由能计算使用平民化的产品设计理念以及为实现这一理念相…
基于配体的方法预测PDE10A活性——高质量公开数据的预测性QSAR模型

基于配体的方法预测PDE10A活性——高质量公开数据的预测性QSAR模型

用于苗头化合物与先导化合物的预测性3D定量构效关系（QSAR）方法在早期药物发现阶段非常有价值。在本案例研究中，我们展示…
膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力

膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力

本案例研究展示了如何用Flare™ FEP1精确计算结合于P2Y1脂质和GPCR界面之间30个配体的结合亲和力。在本文的…
基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

本文以DUD-E的NRAM为子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进…
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