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用水的能量学信息重现KRAS<sup>G12D</sup>选择性抑制剂MTRX1133的哌嗪侧链优化过程

用水的能量学信息重现KRASG12D选择性抑制剂MTRX1133的哌嗪侧链优化过程

本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构（PDB 7RT4）结合位点进行水…
探索更好的电荷模型

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本文介绍了两种偏心电荷模型：XED电荷模型与Astex-DNN电荷模型。XED电荷模型基于化学直觉、根据实验数据比较以改…
在线研讨会（视频回放） | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划

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本视频介绍了Flare自动确定FEP计算最佳λ的新方法。通过预计算获得相空间重叠矩阵可以发现λ值相距太远而无法良好收敛的…
支持向量机——在深度学习时代仍然强大的QSAR模型

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支持向量机 (SVM) 是在药物发现分子性质预测中最常用的机器学习方法之一。近年来，深度学习（DL）方法在药物发现中越来…
Flare V6预告——计算化学先睹为快

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Flare是Cresset基于结构与基于配体的药物设计平台，Flare V6即将在6月份发布。此次先睹为快介绍了三个计算…
Flare V6预告——药化先睹为快

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Flare是Cresset基于结构与基于配体的药物设计平台，Flare V6即将在6月份发布。此次先睹为快介绍了两个药物…
BLAZE云计算——快速地搜索几千万化合物

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Blaze用已知配体的形状和静电特性快速地从大型化合物数据库中搜寻到具有相似特性的化合物，让你少花钱却具有极高的生物学筛…
ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务

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ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算，部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。ORION以专有…
OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

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本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（…
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

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本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估，评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo…
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