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双水记——水分子替换而活性降低的理论解释

双水记——水分子替换而活性降低的理论解释

2012年辉瑞公司的Trujillo等人在 “双水记（a tale of two waters）”一文描述了对hH-PG…
预测BCR-ABL1激酶的别构结合位点

预测BCR-ABL1激酶的别构结合位点

本文以BCR-ABL1激酶为例，演示了如何用LigandScout预测潜在的结合位点，接着用GIST预测结合位点的成药性…
Flare V5发布：创新的科技以及基于配体与基于结构方法的协同

Flare V5发布：创新的科技以及基于配体与基于结构方法的协同

本文介绍了最新版本Flare V5的功能与特性，包括：整合了基于配体的方法Forge；基于结构与基于配体方法的协同使用；…
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

深度生成模型已用来进行从头分子设计，能够生成性质理想的化合物。然而，大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
在基于结构的设计中用Flare Viewer来提高视觉分析的效率

在基于结构的设计中用Flare Viewer来提高视觉分析的效率

很多重要的非经典相互作用不能被传统的分子对接、分子力场等计算方法正确评估，因此视觉分析在基于结构的药物设计中是非常必要且…
XLOGP3+: 可靠的、方便的理化性质计算软件

XLOGP3+: 可靠的、方便的理化性质计算软件

XLOGP3是复旦大学药学院王任小教授课题组开发的脂水分配系数（LogP）计算工具，在国内外获得广泛认可，并被PubCh…
网络研讨会｜Flare V5的FEP方法：新的特性与增强

网络研讨会｜Flare V5的FEP方法：新的特性与增强

在早期的药物发现项目中，自由能微扰 (FEP) 技术越来越多地用于待合成及待测试化合物的优先性排序。Flare中的FEP…
使用深度生成模型设计具有所需药效团的DDR1抑制剂

使用深度生成模型设计具有所需药效团的DDR1抑制剂

本文描述了如何联合使用LigandScout与REINVENT实现深度生成模型 (DGM) 设计具有所需药效团的DDR1…
JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植

JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植

本文以JAK3共价抑制剂PF-06651600为例，演示了如何用Ligandscout的药效团片段筛选方法对片段数据库进…
片段虚拟筛选发现新的KRAS<sup>G12C</sup>共价抑制剂

片段虚拟筛选发现新的KRASG12C共价抑制剂

在本算例中，我们以6TAM的共晶配体为先导化合物，用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段…
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