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侧链虚拟筛选：全PDB和ChEMBL数据分析

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药物化学的优化通常涉对分子的一部分进行替换设计，其目的是在保留化合物活性的同时提高化合物的其他性能。在本研究中，作者进行…
FLARE算例 | 炼金术法FEP预测FXR激动剂的结合自由能

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本文以D3R CG2的Free Energy Set 2数据集的14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例，分析了…
云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选

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VirtualFlow是一款开源的、基于结构的、超高通量虚拟筛选平台，Gorulla等人成功地用8000个核心花两周时间…
云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能

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已经有大量的算例表明，Flare FEP可以可靠地预测化合物的结合亲和力。本文演示了如何借助Cloudam云E算力平台j…
云计算教程｜Gaussian的安装与计算

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本文介绍了如何利用cloudam云计算资源进行Gaussian安装与计算，包括：（1）注册与创建cloudam账号；（2…
Cresset药物发现服务

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药物发现服务 Cresset 计算服务 Cresset不仅提供药物设计软件，而且有专门的团队提供药物发现服务。Cress…
类先导药物的综述与展望

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类先导药物或分子量300以下的药物是当前药典和现代药物化学实践中一个重要的、有时被忽视的组成部分。为了研究类先导药物发现…
Gaussian案例 | 实验及DFT理论计算揭示硬盘驱动器无磁性Ni-P膜的p型掺杂机制

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本研究将密度泛函理论(DFT)计算与电化学阻抗谱(EIS)测试相结合，提出了镍团簇催化次磷酸氧化还原的新机理。DFT计算…
Gaussian教程 | Michael受体与巯基模型的加成反应和反应速率常数的计算

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我们选取了四个Michael受体，分别计算了这些受体与巯基模型的加成反应、计算了能垒并构建了反应势能面。同时我们也介绍了…
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
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