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Spruce—高通量生物大分子结构准备

Spruce—高通量生物大分子结构准备

spruce是一款高精度蛋白结构准备软件，以便下游的应用软件使用。下游的应用包括：基团替换软件BROOD，分子对接软件F…
被高引用的论文是如何产生的？

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为庆祝2020年JCIM创刊60周年推出虚拟专刊，遴选出过去60年间在药物设计和化学信息学领域最具影响力的10篇论文，包…
Gaussian教程 | 计算NICS值评估分子体系的芳香性和反芳香性

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本文介绍了芳香性、反芳香性和NICS值的概念。并以苯环为例，演示如何用Gaussian 16计算体系的NICS值来判断体…
Gaussian教程 | 绘制分子自旋密度图

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本文介绍了电子自旋(spin)与自旋密度(spin density)等相关概念。并以（·CH2-CH2-CH2-CH2-…
网络研讨会｜利用项目知识理解SAR、指导配体设计

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在药物发现项目中，总结和理解大量化合物的SAR既困难又耗时。本次网络研讨会主要介绍如何用Cresset的Forge进行S…
靶向NLRP3炎症小体的策略

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靶向NLRP3炎症小体(inflammasome)是一个爆炸性发展的研究领域。随着这一领域的热情日渐浓厚，几家公司最近开…
Flare教程 | 自定义力场参数

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AMBER力场常用于分子动力学模拟与FEP计算，虽然GAFF力场对大部分体系计算精度足够，但是对于某些分子却不能良好地描…
CDK7抑制剂用于癌症治疗：尝到成功的味道了吗？

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细胞周期依赖性激酶7(CDK7)由于其在转录和细胞周期进程中的双重作用而具有独特的功能。 CDK7在各种类型的癌症中普遍…
云E课堂（12月8日）｜云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能

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本次直播将重点介绍Flare/FEP的特性，并以14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例，演示了如何使用Clou…
蛋白质结构的处理对于炼金术自由能计算准确度的影响

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相对自由能微扰（FEP）方法在制药行业中变得越来越流行。 然而，尽管药物发现周期内存在时间限制，但在部署此类方法时应谨慎…
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