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选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
25.04.20
增强CDPKit的药效团模型
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计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
25.04.17
Flare FEP案例 | 在骨架跃迁实验中用绝对结合自由能计算精确预测活性
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用结合模式元动力学模拟(BPMD)探索配体-蛋白结合模式稳定性
本文介绍了结合模式元动力学(Binding Pose MetaDynamics,BPMD)模拟的开源python实现Op ...
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
在本研究中,来自强生的研究人员利用已知的封帽结构域结合物JNJ-8003进行了一次有针对性的DNA编码库(DEL)筛选, ...
药物相互作用中熵和疏水效应的归因性解释
药物与生物大分子之间的ΔG亲和力及其潜在的非共价相互作用在药物发现中起着至关重要的作用。 ...
原创文章
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
METTL3抑制剂苗头化合物 1 的发现过程综合运用了基于配体的药物设计(LBDD)、结构生物学(SBDD)、QSAR ...
增强CDPKit的药效团模型
本文提供了一个Flare Python拓展,根据被选择的原子,创建芳香环药效团特征描述,可用来直接替换CDPKit药效团 ...
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
Cresset技术的核心在于其专有的XED力场,该力场通过扩展电子分布(XED)来更准确地模拟分子内的静电和轨道相互作用 ...
Flare FEP案例 | 在骨架跃迁实验中用绝对结合自由能计算精确预测活性
鉴于计算方法在活性预测方面相比实验室方法的效率优势日益凸显,加之由于计算机硬件的进步,高性能结构赋能方法的可及性不断提高 ...
用Flare QM分析C-H···O=C氢键相互作用
如果一个分子具有带电原子,那么从真空DFT计算获得的MESP将完全被该电荷主导,这使得计算的MESP不能于指导分子设计的 ...
在Flare里使用TxGemma预测化合物的性质
TxGemma是基于谷歌DeepMind的Gemma模型家族——一系列轻量级、最先进的开源模型——专门训练用于理解和预测 ...
确定药物发现和开发的结构生物学基础
本文探讨结构生物学在药物发现中的应用及挑战。 ...
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