首页 › OpenEye
将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例

将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例

本文介绍了两个将水与静电分析作为基于结构设计核心的应用案例。一个算例来自TYK2 JH2抑制剂，GamePlan的取代假…
CT7001的CDK7/CDK2激酶靶标选择性分析

CT7001的CDK7/CDK2激酶靶标选择性分析

本文从激酶特性结合子口袋分析、相互作用分析与生物活性构象稳定性分析等三个角度考察了CT7001对CDK7与CDK2激酶选…
用水的能量学信息重现KRAS<sup>G12D</sup>选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程

用水的能量学信息重现KRASG12D选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程

本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构（PDB 7RT4）结合位点进行水…
ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务

ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务

ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算，部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。ORION以专有…
OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（…
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估，评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo…
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

本文以PDE5A数据集为例，比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择

用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择

本文用两对化学结构仅一个原子差异但活性相差巨大的分子对为例，尝试用FreeForm以不同的力场计算张力能来解释活性差异的…
用OEChem分析Asciminib与ABL的相互作用

用OEChem分析Asciminib与ABL的相互作用

OEChem不仅是一个强大的数据整合工具，而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。本文以最近上市的ABL别构抑制剂As…
用OEChem解决键级与电荷问题

用OEChem解决键级与电荷问题

在本文中，演示了如何读入一个SDF分子结构，用Vina将其docking到一个蛋白结合位点里，然后试图将对接结果用模板法…

关注我们 么么哒！

最新文章

热门标签

高斯骨质疏松骨架跃迁靶点预测靶标预测非经典相互作用非极性分子静电相似性静电势静电互补性静电隧道阿斯利康闭壳层键解离能

友情链接

大家都在搜

微信公众号

微信公众号