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Spruce—高通量生物大分子结构准备

Spruce—高通量生物大分子结构准备

spruce是一款高精度蛋白结构准备软件，以便下游的应用软件使用。下游的应用包括：基团替换软件BROOD，分子对接软件F…
OpenEye | 化合物数据库的准备

OpenEye | 化合物数据库的准备

为了对大型数据库进行搜索以发现潜在的活性化合物，需要对数据库进行合理的准备。本文系统论述了小分子数据库结构准备需要考虑的…
文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

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本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…
OpenEye案例 | 和记黄埔强效、高选择性的PI3Kγ/δ双重抑制剂

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喹唑啉酮是选择性PI3Kγ与PI3Kδ抑制剂的公共片段，在本研究中和记黄埔的科研人员用片段替换软…
OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能

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在本研究中，作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。首先 使用40个已知EcR配体的验证研究表明，当引入配体的…
ROCS案例 | RUNX1/ETO四聚体PPI抑制剂的发现

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Alexander等人借助自由能计算、能量拆解预测了Hot spot、并用实验确认了其中3个氨基酸残基；以Hot spo…
2017年09月13日-广州-OpenEye基于配体的药物设计讲座

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2017年9月13日《OpenEye基于配体的药物设计讲座》为大家介绍OpenEye基于配体的药物设计技术方案、应用与进…
教程 | OMEGA构象搜索

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OMEGA负责生成小分子的3D构象，专门为计算机辅助药物设计中大规模数据库化合物的构象分析而设计，它可快速、可靠地产生多…
SZMAP | 计算水分子

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SZMAP是一种水分子位置与稳定性预测软件软件，它采用半连续泊松-波尔兹曼理论来定量绘制配体结合态受体、无配体结合态受体和配体结构的热力学量变图，可以预测特定水分子对配体结合的稳定化或不稳定化效应，还…
如何获取OpenEye的试用

如何获取OpenEye的试用

OpenEye是非常专业的药物设计软件，本文介绍了OpenEye试用申请流程与安装方法：1) 注册账号；2）在线签字(e-Sign)； 3）生成机器码与授权书 ；4）下载软件；5）License安装。

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