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文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…
OpenEye案例 | 和记黄埔强效、高选择性的PI3Kγ/δ双重抑制剂

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喹唑啉酮是选择性PI3Kγ与PI3Kδ抑制剂的公共片段，在本研究中和记黄埔的科研人员用片段替换软…
OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能

OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能

在本研究中，作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。首先 使用40个已知EcR配体的验证研究表明，当引入配体的…
ROCS案例 | RUNX1/ETO四聚体PPI抑制剂的发现

ROCS案例 | RUNX1/ETO四聚体PPI抑制剂的发现

Alexander等人借助自由能计算、能量拆解预测了Hot spot、并用实验确认了其中3个氨基酸残基；以Hot spo…
2017年09月13日-广州-OpenEye基于配体的药物设计讲座

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2017年9月13日《OpenEye基于配体的药物设计讲座》为大家介绍OpenEye基于配体的药物设计技术方案、应用与进…
教程 | OMEGA构象搜索

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OMEGA负责生成小分子的3D构象，专门为计算机辅助药物设计中大规模数据库化合物的构象分析而设计，它可快速、可靠地产生多…
SZMAP | 计算水分子

SZMAP | 计算水分子

SZMAP是一种水分子位置与稳定性预测软件软件，它采用半连续泊松-波尔兹曼理论来定量绘制配体结合态受体、无配体结合态受体和配体结构的热力学量变图，可以预测特定水分子对配体结合的稳定化或不稳定化效应，还…
如何获取OpenEye的试用

如何获取OpenEye的试用

OpenEye是非常专业的药物设计软件，本文介绍了OpenEye试用申请流程与安装方法：1) 注册账号；2）在线签字(e-Sign)； 3）生成机器码与授权书 ；4）下载软件；5）License安装。
OpenEye案例 | 基于形状静电相似性虚拟筛选发现全新的FabI抑制剂

OpenEye案例 | 基于形状静电相似性虚拟筛选发现全新的FabI抑制剂

在本研究中，作者用了一个独特的策略：形状匹配与静电相似性比较进行基于配体的虚拟筛选，从ASDI数据库中命中几个活性在微摩…
靶点预测–基于ROCS的方案与教程

靶点预测–基于ROCS的方案与教程

形状与静电是分子的两个基本物理性质，如果一个化合物与蛋白的结合位点在形状与静电上互补，那么这个化合物自然而然地成为该蛋白…

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