在骨架跃迁中整合理论环系数据库：RIPK1抑制剂GDC-8264发现路径的回溯性研究

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骨架跃迁是先导化合物优化中的核心策略，其成功在很大程度上依赖于高质量、结构多样的替换片段库。 ...
从晶体学意外到理性设计：通过模拟硫酸根介导的氢键网络重现补体因子B抑制剂的活性优化

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本文概述了诺华公司开发的首个获批补体因子（Factor B, FB）抑制剂Iptacopan的先导化合物发现历程。 ...
计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您？

计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您？

本文系统综述了计算化学在药物发现中用于评估配体–蛋白相互作用和优化配体的主要方法。 ...
用FieldTemplater预测ROS1抑制剂的生物活性构象

用FieldTemplater预测ROS1抑制剂的生物活性构象

在缺乏靶标蛋白共晶结构信息的早期药物发现阶段，准确识别配体的生物活性构象对虚拟筛选与先导化合物优化至关重要。 ...
基于3D形状相似性的靶标预测研究——化合物31的化学基因组学分析

基于3D形状相似性的靶标预测研究——化合物31的化学基因组学分析

本文以化合物31作为查询分子，对ChEMBL35数据库进行基于形状的虚拟筛选，然后对筛选结果进行了化学基因组分析，预测了 ...
查寻分子的准备对基于形状虚拟筛选的影响

查寻分子的准备对基于形状虚拟筛选的影响

基于形状的虚拟筛选已成为从超大型化合物库中识别结构新颖生物活性分子的有力策略。 ...
在线会议 | 自由能微扰(FEP)研究——识别“新型”TYK2配体

在线会议 | 自由能微扰(FEP)研究——识别“新型”TYK2配体

在本次的网络研讨会，Lauren Nelson博士将介绍如何高效运用 Cresset 软件 Flare 中的计算方法，为 ...
大语言模型重塑计算药物设计：在于代码而不是药物

大语言模型重塑计算药物设计：在于代码而不是药物

当我们谈论AI在药物研发中的作用时，总被“AI从零开始设计新药”的科幻故事吸引——仿佛一个超级智能系统取代了整个实验室。 ...
基于 Orb V3 神经网络势的几何优化与扭转角分析：方法评估与应用拓展

基于 Orb V3 神经网络势的几何优化与扭转角分析：方法评估与应用拓展

本文系统评估了由 Orbmol公司提出的新型神经网络势（Neural Network Potential, NNP）—— ...
氟代烯烃作为酰胺的高效生物电子等排体

氟代烯烃作为酰胺的高效生物电子等排体

氟原子的引入不仅改变了乙烯基片段的静电性质，更可能通过形成 C–F⋯C=O 或 C–F⋯H–C 等弱相互作用，增强配体与 ...

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