2025
- 294从晶体学意外到理性设计：通过模拟硫酸根介导的氢键网络重现补体因子B抑制剂的活性优化
- 525计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您？
- 447用FieldTemplater预测ROS1抑制剂的生物活性构象
- 558基于3D形状相似性的靶标预测研究——化合物31的化学基因组学分析
- 584查寻分子的准备对基于形状虚拟筛选的影响
- 245在线会议 | 自由能微扰(FEP)研究——识别“新型”TYK2配体
- 249大语言模型重塑计算药物设计：在于代码而不是药物
- 539基于 Orb V3 神经网络势的几何优化与扭转角分析：方法评估与应用拓展
- 792氟代烯烃作为酰胺的高效生物电子等排体
- 479在缺乏靶标结构信息的情况下解析多种DPPIV配体的结合模式
- 329超越已知领域，发现新型苗头化合物——借助ROCS X搜索万亿级分子
- 316Cadence推出AI驱动的ROCS X人工智能分子搜索，解锁数万亿分子虚拟筛选能力
- 311用Orb V3机器学习力场进行几何优化
- 457用POSIT解决Boltz等AI结构预测中的配体化学问题
- 998AI生成的分子有多新颖？一次现实检验
- 490FEP与3D-QSAR相结合的主动学习范式分析
- 333视频回放 |攻克不可成药靶点——隐秘口袋识别与排序的高精度方法
- 738使用增强采样沿着正则模坐标来探索隐秘口袋——KRASG12D案例研究
- 451福井函数极大值与代谢位点相对应吗?
- 661在线会议 | 人工智能重塑药物发现
- 6272025年的FEP：我们需要一个更大的药物发现工具箱
- 355OE Affinity NES快速结合自由能预测
- 672为何人工智能无法挽救那失败的90%临床试验
- 4333D-QSAR：用于结合亲和力预测的机器学习方法
- 1,162利用自由能微扰（FEP）预测大环JAK2抑制剂Pacritinib衍生物的结合亲合力
- 979Spark™数据库更新发布并新增农业化学品库
- 1,521EFMC最佳实践倡议——从苗头到先导物
- 1,528使用蛋白质-配体相互作用指纹（PLIF）对分子数据进行聚类
- 2,049用结合模式元动力学模拟（BPMD）探索配体-蛋白结合模式稳定性
- 1,422SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
- 1,948药物相互作用中熵和疏水效应的归因性解释
- 1,505选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
- 1,274增强CDPKit的药效团模型
- 1,372计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
- 1,269Flare FEP案例 | 在骨架跃迁实验中用绝对结合自由能计算精确预测活性
- 1,033用Flare QM分析C-H···O=C氢键相互作用
- 1,325在Flare里使用TxGemma预测化合物的性质
- 1,069确定药物发现和开发的结构生物学基础
- 1,547使用Flare™ FEP计算验证AI预测的蛋白质结构模型
- 1,225Flare FEP案例 | 优化靶向亲环素B的三臂抑制剂用于新型MASH的治疗
- 978在线会议 | 使用Flare™ V10中的新功能来帮助识别对您的项目有意义的分子
- 1,262AI助手增强Flare™计算化学能力
- 1,714Flare V10发布——新增绝对自由能微扰、蛋白-蛋白对接、蛋白-配体相互作用指纹等功能
- 1,946Thompson sampling──高效的超大型按需合成库虚拟筛选方法
- 1,620云上虚拟筛选发现强效、选择性ROS1抑制剂
- 2,116REINVENT与精确的结合自由能排序相结合的生成式主动学习
- 2,431Deep Docking——一个增强的基于结构药物发现深度学习平台
- 884在线会议 | 3D-QSAR与FEP联用主动学习对生物等排体进行优先级排序
- 830分子模拟的本质
- 1,671用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
- 341BLAZE虚拟筛选发现调控CCR6的新型别构拮抗剂
- 1,467自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
- 1,6833D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
- 1,417药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
- 1,123用Activity Atlas解决选择性问题
- 1,125将专利数据转化为SAR的3D图
- 1,100用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能
- 1,9083D-QSAR与FEP联用主动学习对药物化学生物等排体进行优先级排序
2024
- 2,105优化π-π T-型相互作用
- 1,469二甲基膦酰基衍生物的细胞膜渗透性
- 1,928生成式分子设计并非看起来那么容易
- 5,766开源软件ADMET-AI的介绍
- 1,448使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计
- 1,724用SPARK水分子替换实验重现MRTX1719基于片段的发现
- 1,326在新型IRAP抑制剂发现与优化项目中使用Blaze™虚拟筛选识别苗头化合物
- 2,408选择性CDK7抑制剂SY-5609的大环化设计
- 1,548利用静电互补性优化气味结合蛋白与拟除虫菊酯的结合
- 2,970基于GIST的水合位点分析及其在基于结构设计中的应用
- 1,927用XED场技术与SQM分析分子间硫-氧/氮孤对电子相互作用
- 1,796用ORCA计算VCD图谱进行绝对构型的指认
- 1,869在学术写作中使用ChatGPT三种方式
- 1,352Flare™ FEP——模拟电荷变化以及更新的分析功能
- 1,193用Cresset的药物发现工具解锁分子设计的创造潜力
- 1,007Cresset和Enamine扩展合作，为靶向蛋白降解提供新型连接臂库
- 1,567用静电互补性与分子对接打分对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段进行优先级排序
- 2,914克服药物发现与开发的关键挑战——用AI技术预测ADMET
- 2,267蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
- 1,846超大化学空间3D虚拟筛选新模式
- 1,865计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
- 1,715Flare V9先睹为快——前沿的科学、集成和可用性
- 1,266pyFlare获取高级数据可视化和计算功能的适应性
- 2,153识别新化学类型的虚拟筛选策略
- 1,566Flare™中的动力学——当模拟带电配体时离子强度的重要性
- 2,001Flare™中的分子动力学——模拟膜蛋白和监测稳定性
- 1,394使用Spark™连接臂数据库解决靶向蛋白质降解的连接臂设计挑战
- 1,607Spark™新增连接臂数据库以解决蛋白降解剂连接臂设计的难题
- 2,206PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计
- 1,924用计算构象预组织对大环CDK2抑制剂设计进行优先级排序
- 2,220用计算方法研究大环分子的构象预组织——BCL6抑制剂的案例分析
- 2,606噁拉戈利（Elagolix）阻转异构体的QM扭转角分析
- 2,813鸡蛋花素的ECD光谱计算
- 1,127Cresset设立新的副总裁职位以领导其人工智能（AI）战略
- 2,656分子内硫-孤对电子相互作用
- 1,785虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
- 1,581避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
- 2,511配体熵很难但不应被忽略
- 2,899基于结构虚拟筛选的科学与艺术
- 1,478在PROTAC设计中使用静电互补性
- 1,939PROTAC连接臂的设计与评估
- 1,938使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
- 1,781用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
- 1,465QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
- 2,620用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
- 2,637基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
- 1,745用QSAR模型对新设计的分子进行优先级排序——SARS-CoV-2 Mpro抑制剂的2D与3D-QSAR研究
- 2,266在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
- 1,534锁定生物活性构象增强活性
- 4,023QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨
- 2,555Flare V8发布
- 1,5422024年Cresset用户会(UGM2024)
- 1,925Flare V8新特性介绍
- 2,006替换类药化合物的苯胺子结构
- 1,550在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
2023
- 2,171自由能微扰（FEP）方法适用于您的项目吗？
- 3,829偏电荷（ partial charge）的计算
- 5,098势能面——联系分子结构与能量的纽带
- 2,080通过扭转角分析发现先导化合物优化的机会
- 1,731从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
- 1,750在计算中使用Hit Expander与QSAR进行新分子设计与打分
- 1,321用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化
- 2,600用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计
- 2,075基于配体的方法预测PDE10A活性——高质量公开数据的预测性QSAR模型
- 2,506膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力
- 2,727基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能
- 2,278对最有前景的虚拟筛选苗头化合物进行优先级排序
- 3,567用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率
- 2,642警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能
- 2,951用数据融合增强分子对接的虚拟筛选性能
- 2,171在Flare™中用RDKit指纹与2D描述符建立QSAR模型
- 1,709Flare™系综共价对接
- 2,288用DFT//GFN2-xTB 混合方法自定义力场参数
- 4,062使用半经验GFN2-xTB计算来处理含100多个原子较大分子结构的能量最小化
- 1,517在Flare里创建肽类分子
- 1,729使用Flare的组合库枚举器（Library enumerator）进行化学修饰
- 1,939用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 Mpro 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究
- 2,927Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果
- 3,062选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁
- 2,561加速发现新型靶向蛋白降解疗法
- 2,383应用FBDD识别新化合物并增加配体修饰的多样性
- 2,663利用Flare™中的分子动力学模拟深入了解膜蛋白复合物
- 3,177用基于配体的蛋白叠合来解释CT7001对CDK7/CDK2激酶选择性
- 2,229将Flare™ Hit Expander和Flare FEP快速且准确的苗头到先导过程用于CDK9抑制剂的发现
- 3,989用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验
- 1,682用Flare Python API实现根据配体叠合来调整蛋白的取向
- 2,441用Pyflare来简化苗头化合物的识别
- 2,739在基于配体3D相似性的虚拟筛选中使用Tversky
- 2,511交付结构新颖、具有自主知识产权与体内活性的先导化合物
- 3,978从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计
- 2,189什么时候应该使用药效团约束
- 2,210Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间
- 2,655Flare的R-基团分析（R-Group Analysis）
- 2,095Flare V7——先睹为快
- 1,726用场技术设计新型鞘氨醇激酶1（SK1）抑制剂
- 3,125用场技术筛选EGFR激酶抑制剂
- 3,819用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计
- 2,572用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计
- 2,610用静电分析TYK2 JH1抑制剂铰链结合片段的SAR
- 2,909基于反应的虚拟化合物库枚举——JAK3共价抑制剂集中库的生成
2022
- 3,064将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例
- 4,021骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现
- 2,823用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试
- 2,600Flare™V6.1发布——新特性和科学使得快速探索、分析先导化合物和配体系列、高效交流项目结果成为可能
- 3,586用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现
- 2,430在药物发现中利用蛋白-DNA/RNA相互作用
- 3,012Cresset从SEP获得大量增长资金
- 3,434数据驱动的微扰网络生成用于相对结合自由能计算
- 2,738识别抗肺结核的新型抑制剂——用活性位点生成InhA还原酶抑制剂的新设计
- 2,220Hit Expander——一种快速评估并逐步完成苗头到先导流程的新方法，湿化学费用最少
- 1,664用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式
- 1,897与 Cresset Discovery 合作推进您的小分子设计项目
- 2,006Flare V6.1——计算化学先睹为快
- 1,521Flare V6.1——药化先睹为快
- 4,937用分子动力学模拟生成蛋白构象系综用于对接实验更具生物学合理性
- 2,496用Flare QM计算化合物的ECD图谱
- 2,784配体设计中水分子的计算探索
- 2,226用Flare V6的实时扭转角分析增强新分子设计
- 3,677自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算
- 3,546联合使用3D-RISM与GIST计算密闭结合位点里水的热力学性质
- 3,365PD-1/PD-L1相互作用抑制剂——探索结合口袋的性质引入新的相互作用
- 3,419计算服务案例 | 用虚拟筛选识别有前途的癫痫抑制剂
- 3,490Flare V6发布——新特性、新功能与改进
- 7,019基于结构药物设计中的静电互补性
- 1,861Andy Vinter纪念会
- 2,592用Ignite™进行3D虚拟筛选
- 4,827CT7001的CDK7/CDK2激酶靶标选择性分析
- 4,940用水的能量学信息重现KRASG12D选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程
- 3,036探索更好的电荷模型
- 2,194在线研讨会（视频回放） | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划
- 4,695支持向量机——在深度学习时代仍然强大的QSAR模型
- 2,235Flare V6预告——计算化学先睹为快
- 2,168Flare V6预告——药化先睹为快
- 2,879BLAZE云计算——快速地搜索几千万化合物
- 3,437ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务
- 3,920OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好
- 7,621ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
- 4,088用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
- 3,799用SPARK™的生物等排体替换来解决代谢稳定性问题
- 2,817在线会议邀请 | 在小分子发现中协调化学与化合物测试
- 1,917超越相似性的设计——使用活性位点为您的项目生成新设计
- 3,454了解水在蛋白-配体复合物中的作用以及在药物发现中何时需要考虑水
- 3,474为下一代新型农用化学品寻找新IP——Globachem与Cresset Discovery续签合同
- 5,422用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择
- 2,535将静电与水的分析作为基于结构设计的核心
- 3,624用XED力场分析激酶抑制剂的C─H···O=C氢键
- 4,884用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析
- 4,893点到面距离与NICS芳香性计算
- 2,647在Flare里计算两个环的几何中心及其之间的距离
- 3,090用BLAZE虚拟筛选11βHSD-1发现结构多样的先导化合物
2021
- 2,686用OEChem分析Asciminib与ABL的相互作用
- 6,063用OEChem解决键级与电荷问题
- 2,725用OEChem分析Abemaciclib与CDK6的相互作用
- 2,386OEChem数据处理从圣诞快乐开始
- 4,124AutoT&T算例——DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现
- 10,048分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤
- 3,334优化SPARK中的对接路径——在结合位点里直接计算配体-蛋白相互作用来发现新的结果
- 2,918在线研讨会 | 在配体设计中利用水的相互作用：用GIST分析结合口袋里水的稳定性
- 3,042在线研讨会 | 你为什么还自己进行FEP计算呢？FEP计算外包的案例介绍
- 2,083在线研讨会 | 让药物发现外包的协作与信息交付流畅起来
- 3,343在线研讨会 | 用Torx Test进行测试数据的安排与管理
- 4,451综合利用基于结构与基于配体的方法理解SD抑制剂的SAR
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- 5,448KRASG12C共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换
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- 4,617借助重要的水加速基于结构的ATX抑制剂先导化合物优化
- 3,808Flare FEP：兼顾速度、精度与易用性，极具竞争力
- 3,938水分子替换导致BTK抑制剂活性下降100多倍的理论解释
- 8,092关于分子对接预测结合模式的问题
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2020
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