2025
- 3用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
- 213自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
- 2203D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
- 389药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
- 223用Activity Atlas解决选择性问题
- 475将专利数据转化为SAR的3D图
- 189用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能
- 634用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序
2024
- 735优化π-π T-型相互作用
- 557二甲基膦酰基衍生物的细胞膜渗透性
- 455生成式分子设计并非看起来那么容易
- 3,051开源软件ADMET-AI的介绍
- 762使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计
- 1,107用SPARK水分子替换实验重现MRTX1719基于片段的发现
- 707在新型IRAP抑制剂发现与优化项目中使用Blaze™虚拟筛选识别苗头化合物
- 1,009选择性CDK7抑制剂SY-5609的大环化设计
- 758利用静电互补性优化气味结合蛋白与拟除虫菊酯的结合
- 1,784基于GIST的水合位点分析及其在基于结构设计中的应用
- 731用XED场技术与SQM分析分子间硫-氧/氮孤对电子相互作用
- 815用ORCA计算VCD图谱进行绝对构型的指认
- 943在学术写作中使用ChatGPT三种方式
- 709Flare™ FEP——模拟电荷变化以及更新的分析功能
- 643用Cresset的药物发现工具解锁分子设计的创造潜力
- 524Cresset和Enamine扩展合作，为靶向蛋白降解提供新型连接臂库
- 863用静电互补性与分子对接打分对ACK1激酶抑制剂铰链结合片段进行优先级排序
- 1,402克服药物发现与开发的关键挑战——用AI技术预测ADMET
- 898蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
- 932超大化学空间3D虚拟筛选新模式
- 1,214计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
- 1,081Flare V9先睹为快——前沿的科学、集成和可用性
- 715pyFlare获取高级数据可视化和计算功能的适应性
- 1,100识别新化学类型的虚拟筛选策略
- 953Flare™中的动力学——当模拟带电配体时离子强度的重要性
- 943Flare™中的分子动力学——模拟膜蛋白和监测稳定性
- 861使用Spark™连接臂数据库解决靶向蛋白质降解的连接臂设计挑战
- 1,114Spark™新增连接臂数据库以解决蛋白降解剂连接臂设计的难题
- 1,304PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计
- 1,442用计算构象预组织对大环CDK2抑制剂设计进行优先级排序
- 1,316用计算方法研究大环分子的构象预组织——BCL6抑制剂的案例分析
- 1,246噁拉戈利（Elagolix）阻转异构体的QM扭转角分析
- 1,365鸡蛋花素的ECD光谱计算
- 746Cresset设立新的副总裁职位以领导其人工智能（AI）战略
- 1,391分子内硫-孤对电子相互作用
- 1,102虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
- 960避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
- 1,406配体熵很难但不应被忽略
- 2,151基于结构虚拟筛选的科学与艺术
- 971在PROTAC设计中使用静电互补性
- 1,308PROTAC连接臂的设计与评估
- 1,338使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
- 1,029用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
- 841QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
- 1,773用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
- 1,569基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
- 1,058用QSAR模型对新设计的分子进行优先级排序——SARS-CoV-2 Mpro抑制剂的2D与3D-QSAR研究
- 1,223在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
- 942锁定生物活性构象增强活性
- 2,438QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨
- 1,320Flare V8发布
- 1,0692024年Cresset用户会(UGM2024)
- 1,185Flare V8新特性介绍
- 1,093替换类药化合物的苯胺子结构
- 942在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
2023
- 1,512自由能微扰（FEP）方法适用于您的项目吗？
- 2,350偏电荷（ partial charge）的计算
- 2,522势能面——联系分子结构与能量的纽带
- 1,439通过扭转角分析发现先导化合物优化的机会
- 1,069从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
- 1,136在计算中使用Hit Expander与QSAR进行新分子设计与打分
- 923用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化
- 1,569用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计
- 1,239基于配体的方法预测PDE10A活性——高质量公开数据的预测性QSAR模型
- 1,814膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力
- 1,832基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能
- 1,484对最有前景的虚拟筛选苗头化合物进行优先级排序
- 2,689用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率
- 1,966警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能
- 2,013用数据融合增强分子对接的虚拟筛选性能
- 1,379在Flare™中用RDKit指纹与2D描述符建立QSAR模型
- 1,081Flare™系综共价对接
- 1,371用DFT//GFN2-xTB 混合方法自定义力场参数
- 2,192使用半经验GFN2-xTB计算来处理含100多个原子较大分子结构的能量最小化
- 1,059在Flare里创建肽类分子
- 1,123使用Flare的组合库枚举器（Library enumerator）进行化学修饰
- 1,496用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 Mpro 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究
- 2,198Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果
- 2,529选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁
- 1,889加速发现新型靶向蛋白降解疗法
- 1,645应用FBDD识别新化合物并增加配体修饰的多样性
- 1,918利用Flare™中的分子动力学模拟深入了解膜蛋白复合物
- 2,106用基于配体的蛋白叠合来解释CT7001对CDK7/CDK2激酶选择性
- 1,588将Flare™ Hit Expander和Flare FEP快速且准确的苗头到先导过程用于CDK9抑制剂的发现
- 2,609用分子动力学模拟生成蛋白构象系综以用于生物学更加合理的分子对接实验
- 1,172用Flare Python API实现根据配体叠合来调整蛋白的取向
- 1,693用Pyflare来简化苗头化合物的识别
- 1,855在基于配体3D相似性的虚拟筛选中使用Tversky
- 1,994交付结构新颖、具有自主知识产权与体内活性的先导化合物
- 2,888从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计
- 1,647什么时候应该使用药效团约束
- 1,617Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间
- 1,583Flare的R-基团分析（R-Group Analysis）
- 1,538Flare V7——先睹为快
- 1,202用场技术设计新型鞘氨醇激酶1（SK1）抑制剂
- 2,245用场技术筛选EGFR激酶抑制剂
- 3,119用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计
- 1,992用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计
- 1,964用静电分析TYK2 JH1抑制剂铰链结合片段的SAR
- 2,249基于反应的虚拟化合物库枚举——JAK3共价抑制剂集中库的生成
2022
- 2,484将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例
- 3,277骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现
- 2,273用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试
- 1,995Flare™V6.1发布——新特性和科学使得快速探索、分析先导化合物和配体系列、高效交流项目结果成为可能
- 2,940用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现
- 1,741在药物发现中利用蛋白-DNA/RNA相互作用
- 2,654Cresset从SEP获得大量增长资金
- 2,904数据驱动的微扰网络生成用于相对结合自由能计算
- 2,230识别抗肺结核的新型抑制剂——用活性位点生成InhA还原酶抑制剂的新设计
- 1,590Hit Expander——一种快速评估并逐步完成苗头到先导流程的新方法，湿化学费用最少
- 1,209用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式
- 1,411与 Cresset Discovery 合作推进您的小分子设计项目
- 1,491Flare V6.1——计算化学先睹为快
- 1,185Flare V6.1——药化先睹为快
- 3,753用分子动力学模拟生成蛋白构象系综用于对接实验更具生物学合理性
- 1,853用Flare QM计算化合物的ECD图谱
- 2,136配体设计中水分子的计算探索
- 1,640用Flare V6的实时扭转角分析增强新分子设计
- 2,544自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算
- 2,640联合使用3D-RISM与GIST计算密闭结合位点里水的热力学性质
- 2,573PD-1/PD-L1相互作用抑制剂——探索结合口袋的性质引入新的相互作用
- 2,972计算服务案例 | 用虚拟筛选识别有前途的癫痫抑制剂
- 2,757Flare V6发布——新特性、新功能与改进
- 5,454基于结构药物设计中的静电互补性
- 1,339Andy Vinter纪念会
- 2,009用Ignite™进行3D虚拟筛选
- 3,905CT7001的CDK7/CDK2激酶靶标选择性分析
- 4,132用水的能量学信息重现KRASG12D选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程
- 2,302探索更好的电荷模型
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- 1,812Flare V6预告——计算化学先睹为快
- 1,715Flare V6预告——药化先睹为快
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- 6,360ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
- 3,289用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
- 3,189用SPARK™的生物等排体替换来解决代谢稳定性问题
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- 2,820用XED力场分析激酶抑制剂的C─H···O氢键
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2021
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2020
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