摘要:OEChem不仅是一个强大的数据整合工具,而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。本文以最近上市的CDK4/6抑制剂abemaciclib与CDK6的复合物结构PDB 5L2S为例,演示了如何用oechem进行相互作用分析,然后再用oedepict进行可视化。
前言
OEChem不仅是一个强大的数据整合工具,而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。本文以最近上市的CDK4/6抑制剂abemaciclib与CDK6的复合物结构PDB 5L2S为例,演示了如何用oechem进行相互作用分析,然后再用oedepict进行可视化。
操作步骤
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拓展应用
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拓展应用
OEChem强大的相互作用分析不仅可以用于视觉分析,还可以用来对docking结果进行后处理,比如过滤出满足特定相互作用模式的化合物。