用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现

用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现

Cbl-b抑制剂与Tyr363相互作用的TEG片段长期以来都保留了1,2，4-三氮唑结构，直到阿斯利康的Quinn等人采 ...
自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法

自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法

近年来，算力的可用性增加改善了配体-蛋白质相对结合自由能（relative binding free energy，RB ...
3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂

3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂

抑制FABP4的小分子可能是治疗代谢综合征的有用候选药物。 ...
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系

药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系

我们展示了一个计算机辅助药物化学设计的练习：使用Activity Atlas1来评估和理解一组CDK2抑制剂的活性特征； ...
用Activity Atlas解决选择性问题

用Activity Atlas解决选择性问题

Activity Atlas1 是 Forge 2 中的一个模块，而Forge 是 Cresset 用于配体设计和 SA ...
将专利数据转化为SAR的3D图

将专利数据转化为SAR的3D图

Activity Atlas1是Forge2 中一种新颖的定性分析方法，而 Forge2 是 Cresset 用于配体设 ...
用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序

用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序

生物等排体替换（Bioisostere replacement）是在药物发现中用于优化候选分子活性和选择性的一个强大且流 ...
使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

本文演示了如何利用Flare水分析工具3D-RISM用来分析大环抑制剂BRD-810与靶标的共晶结构、理解大环的结合模式 ...
用SPARK水分子替换实验重现MRTX1719基于片段的发现

用SPARK水分子替换实验重现MRTX1719基于片段的发现

在本文中，我们利用计算方法重现了新型合成致死药物MRTX1719的基于片段的发现过程。 ...
在新型IRAP抑制剂发现与优化项目中使用Blaze™虚拟筛选识别苗头化合物

在新型IRAP抑制剂发现与优化项目中使用Blaze™虚拟筛选识别苗头化合物

本文分享了Mpakali等人用Blaze虚拟筛选发现靶向IRAP酶活性开放构象抑制剂的研究案例。 ...

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