Python

用基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的效率

本文以DUD-E PDE5A子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析来对Uni-Dock结果进行基于结构的过滤，在 ...

本文以西地那非的一个片段为例，演示了如何用Numpy来求解原子所在面、法线以及点到面距离。 ...

PDB 1UDT是西地那非与PDE5A的复合物晶体结构，本文以其配体西地那非杂环与蛋白A链PHE820侧链苯环几何中心之 ...

OEChem不仅是一个强大的数据整合工具，而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。 ...

在本文中，演示了如何读入一个SDF分子结构，用Vina将其docking到一个蛋白结合位点里，然后试图将对接结果用模板法 ...

OEChem不仅是一个强大的数据整合工具，而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。 ...

OEChem是OpenEye强大的化学信息学工具，可在各种数据整合场景中用于处理各种来源的生物、化学的数据，结构准备以及 ...

本文以DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现为例，演示了如何用Flare分子对接与AutoT&T的裁剪、移植策略相 ...

分子对接后处理可以提高分子对接虚拟筛选的性能。 ...

本文主要提供pyflare的python extension与rdkit等的常见问题。 ...