SPARK教程 | 如何导入试剂创建自己的可搜索数据库

摘要：SPARK是一款生物等排体替换软件，可以实现骨架跃迁、侧链替换、分子生长、分子连接、水分子替换与大环化分子设计等等重要的药物分子设计工作。采用基于反应的库设计策略，可以让设计出来的化合物具有良好合成可行性。本视频演示了如何在SPARK里用Reagent importer导入试剂创建自己的可搜索数据库以便实现基于反应的库设计策略。

为什么要导入试剂

SPARK是一款生物等排体替换软件，可以实现骨架跃迁、侧链替换、分子生长、分子连接、水分子替换与大环化分子设计等等重要的药物分子设计工作。在礼来Baumgartner等人（2020）的测试中，SPARK表现出最佳的侧链虚拟筛选性能。

在对片段的虚拟筛选过程中，如果采用基于反应的库设计策略，可以让设计出来的化合物具有良好合成可行性：因为这些分子是根据您所掌握的反应从试剂或砌块(building block)虚拟合成而来。在博文《用ADMET Predictior与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程》中，我们已经演示了如何采用基于反应的组合库策略，利用SPARK对试剂库进行虚拟筛选重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程。