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侧链虚拟筛选：全PDB和ChEMBL数据分析

侧链虚拟筛选：全PDB和ChEMBL数据分析

药物化学的优化通常涉对分子的一部分进行替换设计，其目的是在保留化合物活性的同时提高化合物的其他性能。在本研究中，作者进行…
文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…
用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物，用SPARK对其进行了基团替换计算实验。结果表明，SPARK在不到1…
SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂

SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂

本文叙述了拜尔公司科研人员用SPARK发现高效、选择性的SOS1抑制剂的研究过程：首先用片段筛选与高通量筛选发现了与SO…
用ADMET Predictior与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程

用ADMET Predictior与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程

以临床药物为先导化合物进行DMPK、结合亲和力与选择性优化是药物发现的一个策略。本文用ADMET Predictor与S…
诺华生物医学研究院用SPARK发现全新的LpxC抑制剂

诺华生物医学研究院用SPARK发现全新的LpxC抑制剂

诺华生物医学研究院使用骨架跃迁软件Spark对图1化合物6的吲唑母核进行骨架替换以发现代替品。经过对最有希望的、打分靠前…
SPARK水分子替换（与Flare联合使用）

SPARK水分子替换（与Flare联合使用）

SPARK水分子替换 在之前的博文《SPARK教程|水分子替换》一文中的中描述了如何进行水分子替换优化化合物的活性，在当…
SPARK | 创造具有自主知识产权的DPP-IV抑制剂

SPARK | 创造具有自主知识产权的DPP-IV抑制剂

本文用二肽基二肽酶IV抑制剂(DPP-IV) 的侧链替换来说明如何用SPARK的片段数据库和高级过滤功能来控制设计出来化…
SPARK教程 | 共价结合抑制剂的骨架跃迁

SPARK教程 | 共价结合抑制剂的骨架跃迁

本文以EGFR激酶共价抑制剂Afatinib为例，描述了如何用SPARK的共价药效团特征进行共价抑制剂弹头的结构替换（跃…
案例 | 用SPARK大环化技术设计大环BRD4抑制剂

案例 | 用SPARK大环化技术设计大环BRD4抑制剂

大环化（Macrocyclization）在制药工业药物发现领域起着至关重要的作用，分子大环化可以帮助您：1）获取更佳的…

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