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用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 M<sup>pro</sup> 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究

用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 Mpro 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究

本文以SARS-CoV-2的3CL Mpro非共价抑制剂为例，演示了如何协同使用Flare FEP与Spark以加速新的…
选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁

选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁

本文以Merck的选择性CDK8抑制剂MSC2530818的衍生物为起点分子，用SPARK对连接臂部分进行了生物等排体替…
从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计

从肽到小分子——分而治之策略重现NNMT抑制剂的设计

本文以田野义小分子NNMT抑制剂的发现为例，联合使用Flare与Spark采用分而治之的策略重现了田野义从肽到小分子的发…
Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间

Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间

2023年1月份，我们发布了SPARK数据库更新，本次发布新增源于专利文献报道的化合物片段库SureChEMBL，大大扩…
用场技术设计新型鞘氨醇激酶1（SK1）抑制剂

用场技术设计新型鞘氨醇激酶1（SK1）抑制剂

在缺乏蛋白-配体复合物结构的情况下，作者通过基于配体的方法FieldTemplater进行基于场的药效团分析以预测已知活…
用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子，经过分子对接预测结合模式，并用SPARK大环化工作流成功地设计出…
用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计

用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计

SPARK的分子大环化向导是一种快速且易于使用的工作流，可生成有意义且结构多样的计算结果，用于指导大环药物的发现。本文以…
骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现

骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现

本文以BMS公开的6o化合物为起点，经SPARK进行骨架跃迁、Hit Expander的快速结构修饰，再进一步通过简单结…
识别抗肺结核的新型抑制剂——用活性位点生成InhA还原酶抑制剂的新设计

识别抗肺结核的新型抑制剂——用活性位点生成InhA还原酶抑制剂的新设计

基于片段的药物发现是一个不断发展的研究领域，将苗头化合物转化为先导分子是其独特的挑战。在本案例研究中，我们用生物等排体解…
用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式

用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式

在Spark中对新生成的骨架进行聚类可以让您能够根据化学类型对化合物进行分组。这样可以轻松识别分子模式，显示出哪些化合物…

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