摘要：ROCS XTM是OpenEye在Orion®软件即服务(SaaS)分子设计平台上推出的万亿级化合物规模新一代虚拟筛选技术。该技术突破商业化合物库限制，通过反应导向的合成子构建超大型2D/3D化学库，并运用主动学习技术进行智能探索。依托OMEGA、ROCS®及FastROCS行业领先的3D构象与形状搜索工具，OpenEye的ROCS X无需枚举全部分子即可快速识别相关可合成化合物。现在发现苗头化合物更快速、更智能！
搜索更多、花费更少、发现更多苗头化合物：万亿级的筛选，百万级的成本
ROCS X简介
ROCS XTM是OpenEye在Orion®软件即服务(SaaS)分子设计平台上推出的万亿级化合物规模新一代虚拟筛选技术。该技术突破商业化合物库限制，通过反应导向的合成子构建超大型2D/3D化学库，并运用主动学习技术进行智能探索。依托OMEGA、ROCS®及FastROCS行业领先的3D构象与形状搜索工具，OpenEye的ROCS X无需枚举全部分子即可快速识别相关可合成化合物。现在发现苗头化合物更快速、更智能！
OpenEye的ROCS X基于合成子空间的查询分子（Query）分区调度技术，实现子结构搜索与3D搜索，使您能够解锁万亿级可合成化学空间的虚拟筛选，加速苗头化合物发现。图示展示了查询分子（Query）N-[3-(氟甲基)苯基]-4-甲基-3-(甲氨基)苯甲酰胺的分区示例。
ROCS X主要特性
- 万亿级虚拟筛选：通过精选化学反应和商品化砌块，构建了数万亿个易获取化合物，并对其进行子结构和3D相似性搜索，这一搜索范围远远超过了供应商数据库中的可用化合物。
- 反应感知型合成子库：ROCS X利用已知反应和精选试剂数据库生成虚拟化合物。这些分子易于合成，并以紧凑的未枚举格式存储。
- 基于3D形状的搜索：ROCS X利用专有的行业领先技术FastROCS和ROCS，使用配体或任何形状查询，进行精确的3D相似性打分。即使在没有已知配体的情况下，也能将您的搜索与生物学相关形状叠合好。
- 为实际应用而构建：与行业合作伙伴共同开发，ROCS X集成了尖端3D搜索和AI引导采样技术，提供超越供应商目录的加速苗头化合物发现。
- AI智能采样：ROCS X使用AI（贝叶斯多臂老虎机算法）高效探索产物空间。您只需采样虚拟库的一小部分，即可回收高排名命中物。
- 在Orion中无缝集成：ROCS X完全集成到Orion云平台，实现从查询到苗头化合物列表的可扩展、按需虚拟筛选工作流程。
客户见证
OpenEye（现为Cadence Molecular Sciences旗下公司）的ROCS X已在Treeline Biosciences的多个治疗领域发现项目中得到广泛应用。截至目前：
- 筛选并合成了150余种新型化合物
- 确认了多种共晶结构
- 得益于反应感知型设计，合成成功率很高
- 成功发现了所有供应商目录中均未收录的苗头化合物
点击此处查看新闻稿。
“借助Cadence ROCS X，Treeline的科学家如今能够搜索数万亿个类药分子——这在几年前还是难以想象的成就···通过运行ROCS X，我们在多个药物发现项目中识别出了新型化学物质，并获得了前景广阔的3D配体-蛋白质结构。”
库容量更大、搜索速度更快、可合成的苗头化合物
OpenEye的化学结构快速叠合技术（ROCS及FastROCS）提供了一种经过验证的3D形状相似性方法，可定量地将分子相似性与可比的生物活性关联起来。其中结合了形状与原子特征的TanimotoCombo打分（TC）在预测分子间生物相似性方面尤为有效。
ROCS X将FastROCS（ROCS的GPU加速版本）与反应感知型、基于合成子的架构相集成，实现了对万亿多个可合成化合物的虚拟筛选。该化合物库由约740万个可购买砌块及精心筛选的化学反应构建而成。
ROCS X集成了业界领先的ROCS与FastROCS技术，专用于3D相似性搜索。该3D ROCS X方法采用贝叶斯老虎机算法，能高效探索万亿级化合物规模的化学空间，以创纪录速度产出形状相似的苗头化合物。
智能采样获取新型、可合成的苗头化合物
为高效探索广阔的3D化学空间，ROCS X采用人工智能引导的主动学习方法。我们的贝叶斯老虎机方法优先进行采样，而FastROCS则评估形状相似性。搜索过程由源自配体或科学家设计的任意形状查询引导，使ROCS X能以最小采样量识别打分靠前的苗头化合物。
TanimotoCombo打分（形状叠合 + 基于原子的叠合）在药物发现应用中已被验证为一种优越方法，可定量估算两个分子呈现相似生物活性的可能性。
通过评估TanimotoCombo打分，ROCS X在仅采样0.0002%的1.3万亿化合物库时，即可回收超过95%的打分靠前苗头化合物。这使其能以高效率和低计算成本识别高分值、化学相关性强的苗头化合物，使ROCS X成为现代药物发现领域高效、经济且可扩展的解决方案。
ROCS X以低计算成本，在仅采样0.0002%的1.3万亿化合物库时，即可高效识别高分值、化学相关性强的苗头化合物，使其成为现代药物发现领域的可扩展解决方案。
OpenEye 3D搜索ROCS X如何助您获益?
- 超越已知化合物：突破商业可用化合物的局限，发现兼具相关性与可合成性的新型化合物，切勿错失最佳苗头化合物。
- 速度与规模兼得：数小时内筛选万亿级化合物，通过智能非枚举搜索，将计算与存储需求降低多个数量级。
- 专为科学家打造：操作简便，专为计算化学家和药物化学家设计，轻松探索超级大规模的化学空间。
是否想亲眼见证ROCS X的强大性能，或了解其如何融入您的发现管线？欢迎联系我们安排演示，或探讨您的具体筛选靶标。
搜索万亿级化合物。发现他人错失的机遇，突破可购买化合物库的局限。通过子结构搜索与3D搜索，结合物理方法与AI技术，解锁海量可合成化学空间——专为现代发现团队打造。
FAQ
1. 我应该在何时使用ROCS X 还是 FastROCS？
使用ROCS X的情况…
- 您拥有关于砌块以及组合化学空间反应的信息时。
- 您希望搜索超过十亿规模的化合物数据库。
- 降低计算成本对您很重要。
使用FastROCS的情况…
- 您拥有所有化合物的完整分子结构。
- 您需要对数据库中的每个分子进行穷尽搜索。
- 您的数据库规模允许进行完整的分子枚举。
简而言之，ROCS X最适合以低成本探索超大规模、基于反应的虚拟库，而FastROCS则适用于在完全枚举的较小规模（百万至十亿级别）分子数据库上进行穷尽的3D搜索。
2. 有哪些可用的反应和试剂？
用户可以使用来自Enamine、Molport和Mcule等供应商的砌块，以及四十多种常用反应。这种组合使用户能够访问超过1.3万亿种可合成化合物的虚拟库。
用户还可以选择附加组件，将内部试剂和反应整合到现有库中。有关详细信息，请联系sales@eyesopen.com。
3. 如何从商业供应商订购苗头化合物？
可以通过直接向供应商提交报价请求来订购化合物。请在您的请求中包含以下信息：
- 所需结构（SMILES或SD格式）
- 所需数量
- 供应商联系方式：
- Mcule: order@mcule.com
- Enamine: libraries@enamine.net
- Molport: customerservice@molport.com
4. 我可以使用ROCS X进行搜索的分子数量有限制吗？
ROCS X旨在探索现有方法无法达到的化学空间。客户已使用OpenEye ROCS X搜索的虚拟库包含数百万亿分子。
5. 我如何获得ROCS X的访问权限？
ROCS X可作为现成的云解决方案提供，也可作为定制解决方案提供，以精确满足贵公司的业务需求。
请通过sales@eyesopen.com联系我们。
