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分子内长程相互作用项对构象生成方法的性能影响——以A1O分子生物活性构象预测为例
25.11.16
用XedeX进行构象搜索
25.11.03
在骨架跃迁中整合理论环系数据库:RIPK1抑制剂GDC-8264发现路径的回溯性研究
25.10.23
从晶体学意外到理性设计:通过模拟硫酸根介导的氢键网络重现补体因子B抑制剂的活性优化
25.10.19
计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您?
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查寻分子的准备对基于形状虚拟筛选的影响
基于形状的虚拟筛选已成为从超大型化合物库中识别结构新颖生物活性分子的有力策略。 ...
超越已知领域,发现新型苗头化合物——借助ROCS X搜索万亿级分子
ROCS XTM是OpenEye在Orion®软件即服务(SaaS)分子设计平台上推出的万亿级化合物规模新一代虚拟筛选技 ...
Cadence推出AI驱动的ROCS X人工智能分子搜索,解锁数万亿分子虚拟筛选能力
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3D-QSAR:用于结合亲和力预测的机器学习方法
3D-QSAR是OpenEye云计算平台ORION一个用于预测结合亲和力的方法,其利用分子的完整三维相似性,使用形状(来 ...
Thompson sampling──高效的超大型按需合成库虚拟筛选方法
在过去五年中,虚拟筛选超大型按需合成库已成为药物发现项目中识别苗头化合物的强大工具。 ...
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云上虚拟筛选发现强效、选择性ROS1抑制剂
ROS1重排占非小细胞肺癌患者的1-2%,然而在临床上还没有选择性靶向ROS1的疗法。 ...
原创文章
在基于配体3D相似性的虚拟筛选中使用Tversky
本文介绍了基于配体3D相似性计算两种主要方法Tanimoto与Tversky,并将ROCS Tversky相似性方法与文 ...
ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务
ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算,部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。 ...
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估,评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo ...
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总
深度生成模型已用来进行从头分子设计,能够生成性质理想的化合物。 ...
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