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Flare V9先睹为快——前沿的科学、集成和可用性
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文章标签 "ROCS"
在基于配体3D相似性的虚拟筛选中使用Tversky
本文介绍了基于配体3D相似性计算两种主要方法Tanimoto与Tversky,并将ROCS Tversky相似性方法与文…
原创文章
小墨
Benchmarking
2023-04-17
1,425
0
ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务
ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算,部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。ORION以专有…
小墨
discovery service
2022-04-18
2,002
0
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估,评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo…
原创文章
小墨
Benchmarking
2022-03-15
5,557
0
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总
深度生成模型已用来进行从头分子设计,能够生成性质理想的化合物。然而,大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
原创文章
小墨
案例
2021-07-21
3,098
0
ROCS案例 | RUNX1/ETO四聚体PPI抑制剂的发现
Alexander等人借助自由能计算、能量拆解预测了Hot spot、并用实验确认了其中3个氨基酸残基;以Hot spo…
小墨
OpenEye
2017-09-16
3,680
1
OpenEye案例 | 基于形状静电相似性虚拟筛选发现全新的FabI抑制剂
在本研究中,作者用了一个独特的策略:形状匹配与静电相似性比较进行基于配体的虚拟筛选,从ASDI数据库中命中几个活性在微摩…
小墨
OpenEye
2017-03-26
3,880
1
基于ROCS的靶标预测方案与教程
形状与静电是分子的两个基本物理性质,如果一个化合物与蛋白的结合位点在形状与静电上互补,那么这个化合物自然而然地成为该蛋白…
原创文章
小墨
OpenEye
2017-01-31
11,935
7
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蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
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