摘要:OpenEye是非常专业的药物设计软件,本文介绍了OpenEye试用申请流程与安装方法:1) 注册账号;2)在线签字(e-Sign); 3)生成机器码与授权书 ;4)下载软件;5)License安装。

如何获取OpenEye的试用

一. 申请试用

在浏览器里打开链接: https://www.eyesopen.com/request-evaluation,进行账号注册。

如果你注册不成功,请在填写中文注册信息后、再下载试用授权书,签字后将扫描件电子版发给我们(info@molcalx.com)以便安排后续试用事宜。

二. 生成机器码与授权书

2.1 提供中文注册信息

完成在线申请与签名后,请发邮件到info@molcalx.com, 告知您的中文注册信息:

姓名:
电邮:
电话:
单位:
院系:
地址:省-市-区-街道-门牌
邮编:

我们收到邮件后会人工确认注册信息,并提供HOSTID生成器;凭借HOSTID, 我们给你生成License文件:oe_license.txt。

2.2 机器码的生成

下载到的hostid生成器为一个压缩文件:oehost.zip。 将该文件解压到硬盘,比如Windows的E盘,Linux或Mac OS的某个文件夹。解压后的会释放出4个文件:

oehostid
oehostid.exe
oehostid_32
oehostid_osx

其中oehostid,oehostid_32用于Linux的64BIT、32BIT操作系统;oehostid.exe用于windows操作系统;oehostid_osx用于Mac OS X系统。

Windows操作系统

  1. 键入命令行模式
  2. 点击开始按钮,在”搜索程序和文件”(见Figure 1)处键入powershell,按回车健(Enter健),弹出Powershell命令行窗口。
    Windows Command line

    Figure 1. Windows的命令行

  3. 目录切换
  4. 在Powershell窗口,键入命令:
    cd e:/
    则当前路径切换到e盘。

  5. 生成hostid
  6. 假设你下载oehost.zip解压后的oehostid.exe解压后在在E根目录, 您可以键入如下命令获得hostid:
    ./oehostid.exe

Linux系统

直接在命令行键入:

[me@linuxbox me]$oehostid

Mac系统

直接在命令行键入:

[me@linuxbox me]$oehostid_osx

三. 下载软件

将收到的oe_license.txt后,登陆OpenEye账号,下载软件时会提示请上传oe_license.txt,上传后,你就可以下载对应的软件。

下载地址:https://www.eyesopen.com/downloads

四. 安装

以ROCS为例,请参考文档的安装部分:https://docs.eyesopen.com/rocs/install.html

4.1 Mac OS X, Linux等Unix的Shell下安装的要点

  1. 环境变量OE_DIR的设定
  2. 在shell里,解压openeye软件,生成openeye目录,申明变量OE_DIR为openeye的目录即可:

    [me@linuxbox me]$export OE_DIR=/完/整/路/径/openeye

    将收到的oe_license.txt放在该目录下即可。

  3. 环境变量OE_LICENSE的设定
  4. 如果需要自定义指定license文件(oe_license.txt),用环境变量OE_LICENSE指向oe_license.txt:

    [me@linuxbox me]$export OE_LICENSE=/完/整/路/径/oe_license.txt

  5. 将OE的应用添加到PATH里,以便直接键入命令可用
  6. [me@linuxbox me]$export PATH=$PATH:$OE_DIR/bin

更多的SHELL相关内容(适用于Mac、Linux、cygwin),请参考《Linux命令极简教程》一文。

4.2 Windows下License安装的要点

请创建环境变量OE_LICENSE并指向licene文件oe_license.txt, 具体方法:

鼠标右键点击我的电脑>属性>高级>环境变量, 新建一个系统环境变量或用户变量为OE_LICENSE, 变量值通过浏览文件读入(或直接键入路径文件名)你的oe_license.txt,确定即可。

更详细的操作步骤,可以参考百度经验:http://jingyan.baidu.com/article/1e5468f97c8172484861b710.html

五. OpenEye数据库下载

  1. 虚拟筛选用数据库
  2. OpenEye提供了部分预处理过的化合物数据库,比如EMolecules: https://www.eyesopen.com/database-conformational

  3. BROOD骨架跃迁用数据库
  4. http://www.eyesopen.com/db-downloads

六. OpenEye使用手册与教程

在线安装方法、使用手册、教程:https://docs.eyesopen.com

七. 您的中文注册信息

申请申请的中文信息提交