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云上虚拟筛选发现强效、选择性ROS1抑制剂
ROS1重排占非小细胞肺癌患者的1-2%,然而在临床上还没有选择性靶向ROS1的疗法。 ...
原创文章
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估,评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo ...
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对 ...
被高引用的论文是如何产生的?
为庆祝2020年JCIM创刊60周年推出虚拟专刊,遴选出过去60年间在药物设计和化学信息学领域最具影响力的10篇论文,包 ...
OpenEye | 化合物数据库的准备
为了对大型数据库进行搜索以发现潜在的活性化合物,需要对数据库进行合理的准备。 ...
教程 | OMEGA构象搜索
OMEGA负责生成小分子的3D构象,专门为计算机辅助药物设计中大规模数据库化合物的构象分析而设计,它可快速、可靠地产生多 ...
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如何获取OpenEye的试用
OpenEye是非常专业的药物设计软件,本文介绍了OpenEye试用申请流程与安装方法:1) 注册账号;2)在线签字(e-Sign); 3)生成机器码与授权书 ;4)下载软件;5)License安装。 ...
虚拟筛选假阳性、假阴性产生的原因
本文通过比较高通量筛选(HTS)与虚拟筛选(VS),讨论了分子对接虚拟筛选产生假阳性与假阴性的原因, 发现不合适的分子内 ...
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