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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估,评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo…
原创文章
小墨
Benchmarking
2022-03-15
4,980
0
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…
小墨
Benchmarking
2022-03-02
2,626
1
被高引用的论文是如何产生的?
为庆祝2020年JCIM创刊60周年推出虚拟专刊,遴选出过去60年间在药物设计和化学信息学领域最具影响力的10篇论文,包…
原创文章
小墨
新闻动态
2021-01-19
1,976
0
OpenEye | 化合物数据库的准备
为了对大型数据库进行搜索以发现潜在的活性化合物,需要对数据库进行合理的准备。本文系统论述了小分子数据库结构准备需要考虑的…
原创文章
小墨
OpenEye
2020-09-09
5,635
1
教程 | OMEGA构象搜索
OMEGA负责生成小分子的3D构象,专门为计算机辅助药物设计中大规模数据库化合物的构象分析而设计,它可快速、可靠地产生多…
原创文章
小墨
OMEGA
2017-06-16
4,872
1
BROOD
Omega
OpenEye
安装
数据库
试用
如何获取OpenEye的试用
OpenEye是非常专业的药物设计软件,本文介绍了OpenEye试用申请流程与安装方法:1) 注册账号;2)在线签字(e-Sign); 3)生成机器码与授权书 ;4)下载软件;5)License安装。
小墨
OpenEye
2017-05-31
7,217
0
虚拟筛选假阳性、假阴性产生的原因
本文通过比较高通量筛选(HTS)与虚拟筛选(VS),讨论了分子对接虚拟筛选产生假阳性与假阴性的原因, 发现不合适的分子内…
小墨
分子对接
2016-07-03
8,050
9
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基于结构虚拟筛选的科学与艺术
在PROTAC设计中使用静电互补性
2024-03-21
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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
2024-03-20
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