摘要:2021年Cresset用户会(UGM2021)定于2021年6月16-17日以网络会议方式召开。Cresset的科学家们将展示最新技术以及即将推出的应用,以帮助你尽可能高效地设计最佳分子, 我们解决方案的用户也将展示他们的研究案例。

2021年Cresset用户会(UGM2021)-墨灵格的博客

概述

Cresset的科学家们将展示最新技术以及即将推出的应用,以帮助你尽可能高效地设计最佳分子。我们解决方案的用户也将展示他们的研究案例。无论您是Cresset的新手、老用户、或者只是想了解我们提供的解决方案,我都很期待在会议上见到您。

适合人群

Computational chemist • Medicinal chemist • Synthetic chemist • Flavor chemist • Fragrance chemist • Head of discovery • Head of modeling and simulation • Head of R&D • Research Scientist • CSO

适合行业

制药、农药、生物科技、香精、香料与化学品工业

时间

2021年6月16日(英国夏令时)9:00-18:45 | 北京时间2021年6月16日16:00-6月17日 2:45

2021年6月17日(英国夏令时)9:00-18:45 | 北京时间2021年6月17日16:00-6月18日 2:45

地点:在线会议(网络会议,复录像)

  1. 6月16日会议录像
  2. 6月17日录像

会议安排

6月16日

注意,以下时间为英国夏令时时间,+7小时为对应的北京时间。或者简单的认为:第一场为北京时间6月16日16:00开始,第二场为北京时间6月18日2:45开始。

第1场 第2场 标题 报告人
9:00 17:00 Welcome from meeting chairman Rob Scoffin, Cresset
9:05 17:05 Introducing Flare™ V5, your integrated platform for ligand and structure-based design Giovanna Tedesco, Head of Products
9:30 17:30 The science behind ligand-based design in Flare V5 Mark Mackey, CSO
9:45 17:45 BaySpace3D searching large 3D spaces Jens Schamberger, Bayer AG
10:05 18:05 Building meaningful models: Application to cardiac inotropy Nathan Kidley, Senior Application Scientist
10:25 18:25 Questions to presenters
10:45 18:45 Close


6月17日

注意,以下时间为英国夏令时时间,+7小时为对应的北京时间。或者简单的认为:第一场为北京时间6月17日16:00开始,第二场为北京时间6月18日2:45开始。

第1场 第2场 标题 报告人
9:00 17:00 Welcome from meeting chairman Rob Scoffin, Cresset
9:05 17:05 New and improved structure-based methods in Flare and docking in Spark Giovanna Tedesco, Head of Products
9:25 17:25 The science behind structure-based design in Flare V5 Mark Mackey, CSO
9:45 17:45 Benchmarking Flare FEP and Open Force Field at Merck KGaA Christina Schindler, Merck KGaA
10:05 18:05 The synergistic relationship between ligand and structure-based methods in Flare Stuart Firth-Clark, Senior Application Scientist
10:25 18:25 Questions to presenters
10:45 18:45 Close

注册方法

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费用

会议费用:无

会议摘要

1. Science behind ligand-based design in Flare V5

Speaker: Mark Mackey, CSO

在本次演讲中,我们将介绍Flare V5基于配体设计的新特性、我们的场算法的变动、以及通过Python API访问我们高级的构象生成和配体叠合算法等等。

2. Science behind structure-based design in Flare V5

Speaker: Mark Mackey, CSO

在本次演讲中,我们将介绍Flare V5中的新技术。包括自由能量微扰(FEP)工作流程的重大改进、全新的水分析方法、以及Cresset实验室推出的令人兴奋的新研究。

3. BaySpace3D searching large 3D spaces

Speaker: Jens Schamberger, Bayer

目前,当前尚未有3D药效团方法可以在不使用暴力枚举情况下探索巨型化学空间,这使得对巨型化学空间的使用受到了限制。BaySpace3D是我们开发的一种高质量的三维药效团方法,这是一种更为精尖复杂、可靠快速搜索大型组合库的方法。该方法利用creset Spark的分子碎片化与重组方法,从形状和静电学角度快速定位库空间中与查询分子相似的区域。拜耳专有空间约含200M新化合物,可以在2小时内搜索完毕。拜耳的先导化合物发现和优化从BaySpace3D中受益匪浅,因为可以从拜耳创新、合成方法描述良好的虚拟三维库中获得创新性的先导化合物。

4. Building meaningful models: Application to cardiac inotropy

Speaker: Nathan Kidley, Senior Application Scientist

计算模型在药物发现中广泛用于活性预测并提醒项目团队注意潜在的问题。然而,模型必须既健壮又值得信赖,以树立信心并从根本上影响项目成果。基于稀疏数据建立的常规安全性模型尤其如此。我们将介绍如何应用Cresset配体和基于结构的方法来对正和负心脏肌力效应的多个主要和脱靶/次要终点建立预测性模型。成功的关键是引导任何产生的分数,并保证结果有意义。 成功的关键是结果分值的自举,并用概率保证结果是有意义的。经过验证的计算模型集成到基于网页的应用程序中,以使药物发现项目团队能够分析其化合物是否有潜在的肌力副作用。

5. Introducing Flare V5, your integrated platform for ligand and structure-based design

Speaker: Giovanna Tedesco, Head of Product Management

Forge基于配体的设计方法无缝集成到Flare,这让Flare演变为一个基于配体和基于结构的药物设计方法协同工作的平台,为下一代药物的设计提供信息。我们将介绍Flare V5中基于配体的药物设计方法的新技术、特性以及增强功能,并提出Flare作为药物发现集成平台的未来发展计划。

6. New and improved structure-based methods in Flare and docking in Spark

Speaker: Giovanna Tedesco, Head of Products

我们将介绍Flare和Spark中新的基于结构的药物设计方法以及改进的方法。在Flare中,新功能有一种新的基于分子动力学模拟的水分子分析方法GIST,显著提升的FEP计算速度与准确性、增强的分子动力学模拟、蛋白能量最小化、分子对接以及许多其他新的功能和改进。最新版本的Spark,我们最受青睐的生物等排体应用软件,现在可以支持在空的蛋白口袋中进行配体生长。在本次报告中,我们会向您展示新的分子对接特性,它能让你在产生的分子中找到具有新的配体-蛋白相互作用的结果。

7. Benchmarking Flare FEP and Open Force Field at Merck KGaA

Speaker: Christine Schindler, Merck KGaA

自由能计算已经成为计算化学家工具箱的一个强大的补充,可在药物发现项目从苗头到先导化合物以及先导化合物优化阶段用来支持基于结构的药物设计。在此,我们根据默克公司FEP基准的数据集以及两个内部项目的数据集,对Flare FEP的准确性进行评估,还将报告在大量内部专有分子上对Open Force Field进行几何优化与自由能计算的评测结果。

8. The synergistic relationship between ligand and structure-based methods in Flare

Speaker: Stuart Firth-Clark, Senior Application Scientist

在为你的药物发现项目绞尽脑汁构思新分子时,利用所有可用的配体和蛋白信息来建立可靠的分子模型是解锁计算化学力量的关键。我们将展示将引入基于配体设计方法的Flare V5是如何使项目数据更详细、丰富地呈现成为可能。利用真实世界的数据,我们将演示如何协同使用配体和结构模型,特别是与精确的静电可视化相结合,为配体设计提供重要的见解。

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