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教程 | Forge分析分子的静电势

教程 | Forge分析分子的静电势

本文演示了如何用Forge展示结构修饰对分子静电势的影响。
教程 | FieldTemplater搜寻药效团模型

教程 | FieldTemplater搜寻药效团模型

FieldTemplater是药物设计软件Forge里生成场药效团模型的模块，它以几个活性化合物为输入条件产生药效团模型（Template）、预测化合物的生物活性构象。本文介绍了FieldTempla…
教程 | SPARK替换结晶水分子

教程 | SPARK替换结晶水分子

如何利用复合物晶体结构的水分子信息，从一个活性很弱的起始化合物出发，经过片段替换（骨架跃迁、侧链替换）大幅提高化合物的活性？本文用Cresset SAPRK软件的生物等排替换功能, 以选择性BTK(B…
Forge教程 | 建立Activity Atlas构效关系模型

Forge教程 | 建立Activity Atlas构效关系模型

Activity Atlas是一种定性构效关系分析方法：研究其静电、形状、疏水性质与活性的函数关系。它用三种分析回答三个基本问题：1) 平均活性分析：活性化合物的公共属性；2）活性悬崖：结构是如何影响…
Forge教程 | kNN QSAR模型的建立及新化合物的活性预测

Forge教程 | kNN QSAR模型的建立及新化合物的活性预测

kNN方法是一种著名、健壮的距离学习方法，当传统的2D与3D-QSAR方法建立不出QSAR模型时采用kNN QSAR模型无疑是最好的选择。本教程介绍了kNN QSAR模型的基本原理、使用kNN QSA…
场技术案例–基于场的虚拟筛选与生物等排体替换发现和优化新型小分子HIV-1进入抑制剂

场技术案例–基于场的虚拟筛选与生物等排体替换发现和优化新型小分子HIV-1进入抑制剂

目前HIV治疗方案产生了大量耐药株和累积毒性，因此迫切需要发展抑制HIV-1复制的新型药物。HIV-1进入抑制是一个引人注目却尚未开发的治疗方法。作者使用场技术（field technology）预测…
2016年11月23日广州-3D-QSAR与骨架跃迁培训班

2016年11月23日广州-3D-QSAR与骨架跃迁培训班

2016年11月23日《3D-QSAR与骨架跃迁培训班》以实用为宗旨、解决实际科研问题为出发点设计培训内容。在本培训班中，可以学习到如何建立3D-QSAR模型、指导新化合物的设计、预测新化合物的活性以…
Torch教程–分子叠合

Torch教程–分子叠合

Torch是Cresset公司专为药物化学家而定制的药物设计软件，可以用来进行化合物的构象搜索、分子叠合、分子形状与静电场比较、SAR（活性悬崖分析）等。本教程演示了如何用Torch进行分子叠合：将一…
Torch教程–构象搜索

Torch教程–构象搜索

Torch是专为药物化学科研人员设计的药物设计软件，提供了方便的计算工具进行化合物构象搜索、分子叠合、分子形状与静电场比较、活性悬崖分析。药物总是以3D构象与靶点相互作用，因此化学的3D结构是非常重要…
Forge教程 | 3D-QSAR建模

Forge教程 | 3D-QSAR建模

本教程以COX-2抑制剂为例，演示了如何用Forge建立3D-QSAR模型的流程：1）导入参比化合物；2）导入训练集化合物与3）测试集化合物；4）自动构象搜索、分子叠合，PLS分析，生成模型与模型验证…

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