自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法

自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法

近年来，算力的可用性增加改善了配体-蛋白质相对结合自由能（relative binding free energy，RB ...
用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能

用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能

HPK1作为一种靶标，其特征在于结合口袋具有较高的构象柔性，并涉及到溶剂化作用的影响，这为使用自由能微扰（FEP）方法预 ...
用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序

用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序

生物等排体替换（Bioisostere replacement）是在药物发现中用于优化候选分子活性和选择性的一个强大且流 ...
Flare™ FEP——模拟电荷变化以及更新的分析功能

Flare™ FEP——模拟电荷变化以及更新的分析功能

Flare V9的一个更新是Flare™ FEP支持在同一计算中处理不同电荷状态的配体。 ...
蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发

蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发

本文探讨了主成分分析（PCA）在蛋白质分子动力学（MD）模拟和药物发现中的应用。 ...
使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞

使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞

Flare FEP在3个GPCR基准测靶标A2A、OX2和P2Y1体系上取得了最先进的性能，进一步验证了其适用于具有挑战 ...
在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力

在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力

G蛋白偶联受体（GPCR）是一类非常大、非常重要的药物靶点。 ...
自由能微扰（FEP）方法适用于您的项目吗？

自由能微扰（FEP）方法适用于您的项目吗？

要想FEP项目取得最佳的成功机会，需要满足许多关键的数据要求，在本文中，我们概述了运行FEP计算的理想起点。 ...
用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化

用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化

子图分析是一种非常有价值的方法，可以提高FEP计算的精度和可靠性，增强其在计算药物发现中的适用性。 ...
用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计

用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计

本文介绍了Cresset自由能微扰计算解决方案Flare FEP让自由能计算使用平民化的产品设计理念以及为实现这一理念相 ...

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