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25.05.07
使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
25.04.30
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
25.04.20
增强CDPKit的药效团模型
25.04.18
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
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在线会议 | 3D-QSAR与FEP联用主动学习对生物等排体进行优先级排序
邀请请您参加2025年2月27日北京时间晚10:00的在线会议《用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物电子等排体进 ...
自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
近年来,算力的可用性增加改善了配体-蛋白质相对结合自由能(relative binding free energy,RB ...
原创文章
用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能
HPK1作为一种靶标,其特征在于结合口袋具有较高的构象柔性,并涉及到溶剂化作用的影响,这为使用自由能微扰(FEP)方法预 ...
原创文章
3D-QSAR与FEP联用主动学习对药物化学生物等排体进行优先级排序
生物等排体替换(Bioisostere replacement)是在药物发现中用于优化候选分子活性和选择性的一个强大且流 ...
原创文章
Flare™ FEP——模拟电荷变化以及更新的分析功能
Flare V9的一个更新是Flare™ FEP支持在同一计算中处理不同电荷状态的配体。 ...
蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
本文探讨了主成分分析(PCA)在蛋白质分子动力学(MD)模拟和药物发现中的应用。 ...
使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
Flare FEP在3个GPCR基准测靶标A2A、OX2和P2Y1体系上取得了最先进的性能,进一步验证了其适用于具有挑战 ...
在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
G蛋白偶联受体(GPCR)是一类非常大、非常重要的药物靶点。 ...
自由能微扰(FEP)方法适用于您的项目吗?
要想FEP项目取得最佳的成功机会,需要满足许多关键的数据要求,在本文中,我们概述了运行FEP计算的理想起点。 ...
用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化
子图分析是一种非常有价值的方法,可以提高FEP计算的精度和可靠性,增强其在计算药物发现中的适用性。 ...
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