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用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 M<sup>pro</sup> 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究

用自由能计算与生物等排体替换来进行SARS-Cov-2 Mpro 半胱氨酸蛋白酶抑制剂的识别研究

本文以SARS-CoV-2的3CL Mpro非共价抑制剂为例，演示了如何协同使用Flare FEP与Spark以加速新的…
Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果

Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果

Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台，本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法，包括用大正则非平…
将Flare™ Hit Expander和Flare FEP快速且准确的苗头到先导过程用于CDK9抑制剂的发现

将Flare™ Hit Expander和Flare FEP快速且准确的苗头到先导过程用于CDK9抑制剂的发现

本案例研究展示了一种联合使用取代位衍生物扫描与自由能计算的工作流，它可以围绕一个苗头化合物来快速探索周围SAR，从而加速…
用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试

用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试

本文以一对结构相差一个溴原子而活性相差500倍的PTP1B抑制剂为例演示了Flare FEP在北京超级云计算中心GTX …
Flare™V6.1发布——新特性和科学使得快速探索、分析先导化合物和配体系列、高效交流项目结果成为可能

Flare™V6.1发布——新特性和科学使得快速探索、分析先导化合物和配体系列、高效交流项目结果成为可能

本文介绍了Flare V6.1版本中新增与增强的部分功能。新增并增强了的科学功能和方法包括R-基团分析(RGA)、Hit…
用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现

用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现

本文以Merck FEP计算基准数据集TNKS2算例中的两个化合物7与5e为例，演示了Flare FEP在速石云计算平台…
数据驱动的微扰网络生成用于相对结合自由能计算

数据驱动的微扰网络生成用于相对结合自由能计算

在本文中，Mark为大家解释了FEP计算相对结合自由能的原理，总结了爱丁堡大学Scheen和Michel文章关于AI生成…
Hit Expander——一种快速评估并逐步完成苗头到先导流程的新方法，湿化学费用最少

Hit Expander——一种快速评估并逐步完成苗头到先导流程的新方法，湿化学费用最少

Hit Expander是Flare的一个新模块，它通过在苗头化合物所有未取代位置上添加小的取代基，使用户能够围绕单个苗…
自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算

自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算

准确的力场对于可靠地预测小分子的热力学性质至关重要。然而，AMBER GAFF/GAFF2和OpenFF之类的通用可迁移…
Flare V6发布——新特性、新功能与改进

Flare V6发布——新特性、新功能与改进

本文介绍了Flare V6增强的功能和新特性，包括增强的可视化功能、基于反应的组合库枚举、量子力学 (QM)计算、结合口…

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