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克服药物发现与开发的关键挑战——用AI技术预测ADMET
24.05.30
Flare V9先睹为快——前沿的科学、集成和可用性
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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
本文以大环ALK抑制剂Lorlatinib发现过程中活性差异20倍的一个分子对为例,演示了它们的构象张力能计算以评估其结…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-06-03
551
0
Flare V9先睹为快——前沿的科学、集成和可用性
Cresset的小分子药物发现CADD解决方案Flare V9即将发布,包含了新增与增强的科学和特性,包括完全集成Spa…
原创文章
小墨
Cresset
2024-05-30
413
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Flare™中的动力学——当模拟带电配体时离子强度的重要性
设置盐浓度以使得结合测定的实验条件与分子动力学(MD)或自由能微扰(FEP)模型相匹配,可以显著提高模拟的准确性,特别是…
原创文章
小墨
Cresset
2024-05-23
393
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Flare™中的分子动力学——模拟膜蛋白和监测稳定性
膜蛋白是一种难以初始化和建模的生物学体系。Flare中的分子动力学可以推演分子体系如何随时间进化,可用于探索分子体系的构…
原创文章
小墨
Cresset
2024-05-22
418
0
PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计
本文用Flare GIST分析了PDE10A的apo结合位点,用计算的水合位点与水合自由能解释了苗头化物与先导化合物优化…
原创文章
小墨
Cresset
2024-05-17
598
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用计算构象预组织对大环CDK2抑制剂设计进行优先级排序
在本文中,我们用计算构象预组织(conformational pre-organization)分析了活性跨度为2个数量…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-05-14
1,011
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用计算方法研究大环分子的构象预组织——BCL6抑制剂的案例分析
本文介绍了构象预组织概念、理论计算方法及其在药物设计中的应用。根据这个理论,人们预期化合物的结合亲和力正比于其构象系综中…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-05-06
828
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虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
通过将基于结构的计算方法、结构生物学和化学知识与基于配体的计算方法相结合,可以优化虚拟筛选的起点,识别可能具有改善的受体…
原创文章
小墨
Cresset
2024-04-10
554
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在PROTAC设计中使用静电互补性
在本实验中,我们使用Spark生成新的PROTAC连接臂,然后用Flare中EC计算方法来评估这些新的PROTAC连接臂…
原创文章
小墨
Cresset
2024-03-21
663
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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-20
579
0
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蛋白质动力学和药物发现——通过主成分分析提升项目开发
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