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24.03.21
使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
24.01.26
2024年Cresset用户会(UGM2024)
24.01.25
Flare V8新特性介绍
24.01.09
在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
23.12.10
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文章标签 "Flare"
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
通过将基于结构的计算方法、结构生物学和化学知识与基于配体的计算方法相结合,可以优化虚拟筛选的起点,识别可能具有改善的受体…
原创文章
小墨
Cresset
2024-04-10
186
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在PROTAC设计中使用静电互补性
在本实验中,我们使用Spark生成新的PROTAC连接臂,然后用Flare中EC计算方法来评估这些新的PROTAC连接臂…
原创文章
小墨
Cresset
2024-03-21
423
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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-20
317
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QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。结…
原创文章
小墨
conformational design
2024-03-18
246
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用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分…
原创文章
小墨
conformational design
2024-03-13
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基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
纤维蛋白聚集是神经退行性疾病的特征,但也是难以进行配体设计的代表性靶标,因为关于结合位点的结构信息有限。在本文中,用基于…
原创文章
小墨
Cresset
2024-03-09
632
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在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-03
607
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锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-02-15
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QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨
在本文中,我们用QPCT/SEN177的共晶结构PDB 6GBX作为QPCTL/SEN177结合模型的代理,用GIST方…
原创文章
小墨
Cresset
2024-02-03
1,045
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Flare V8发布
本文介绍了Cresset的CADD工作台Flare V8新增与增强的科学功能和方法,包括MM/GBSA方法用于计算配体-…
原创文章
小墨
Cresset
2024-01-26
318
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2024-04-14
分子内硫-孤对电子相互作用
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
配体熵很难但不应被忽略
2024-03-30
基于结构虚拟筛选的科学与艺术
2024-03-28
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