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25.01.22
用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
25.01.16
自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
25.01.15
3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
25.01.11
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
25.01.11
用Activity Atlas解决选择性问题
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自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
近年来,算力的可用性增加改善了配体-蛋白质相对结合自由能(relative binding free energy,RB ...
原创文章
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
我们展示了一个计算机辅助药物化学设计的练习:使用Activity Atlas1来评估和理解一组CDK2抑制剂的活性特征; ...
原创文章
用Activity Atlas解决选择性问题
Activity Atlas1 是 Forge 2 中的一个模块,而Forge 是 Cresset 用于配体设计和 SA ...
原创文章
将专利数据转化为SAR的3D图
Activity Atlas1是Forge2 中一种新颖的定性分析方法,而 Forge2 是 Cresset 用于配体设 ...
原创文章
用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物等排体进行优先级排序
生物等排体替换(Bioisostere replacement)是在药物发现中用于优化候选分子活性和选择性的一个强大且流 ...
原创文章
在新型IRAP抑制剂发现与优化项目中使用Blaze™虚拟筛选识别苗头化合物
本文分享了Mpakali等人用Blaze虚拟筛选发现靶向IRAP酶活性开放构象抑制剂的研究案例。 ...
选择性CDK7抑制剂SY-5609的大环化设计
Flare,由Cresset公司研发的综合性药物设计软件,在最新版本V9中集成了Spark模块,后者是一个基于片段的分子 ...
原创文章
Flare™ FEP——模拟电荷变化以及更新的分析功能
Flare V9的一个更新是Flare™ FEP支持在同一计算中处理不同电荷状态的配体。 ...
用Cresset的药物发现工具解锁分子设计的创造潜力
药物发现设计平台Flare V9发布,该版本全面整合了Spark™技术,旨在加速新药研发。 ...
计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
本文以大环ALK抑制剂Lorlatinib发现过程中活性差异20倍的一个分子对为例,演示了它们的构象张力能计算以评估其结 ...
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