用结合模式元动力学模拟（BPMD）探索配体-蛋白结合模式稳定性

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本文介绍了结合模式元动力学（Binding Pose MetaDynamics，BPMD）模拟的开源python实现Op ...
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现

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METTL3抑制剂苗头化合物 1 的发现过程综合运用了基于配体的药物设计（LBDD）、结构生物学（SBDD）、QSAR ...
在Flare里使用TxGemma预测化合物的性质

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TxGemma是基于谷歌DeepMind的Gemma模型家族——一系列轻量级、最先进的开源模型——专门训练用于理解和预测 ...
使用Flare™ FEP计算验证AI预测的蛋白质结构模型

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本文展示了Flare FEP作为一种可靠且用户友好的配体结合自由能预测方法。 ...
在线会议 | 使用Flare™ V10中的新功能来帮助识别对您的项目有意义的分子

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本次会议将介绍Flare V10的一些新功能，包括：新的定量构效关系（QSAR）方法、蛋白质-配体相互作用指纹（PLIF ...
AI助手增强Flare™计算化学能力

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在计算化学和药物发现这个快节奏的世界中，效率和易用性是关键。 ...
Flare V10发布——新增绝对自由能微扰、蛋白-蛋白对接、蛋白-配体相互作用指纹等功能

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Flare V10发布，新版Flare为计算化学和药物化学带来了新增和增强的科学功能。 ...
在线会议 | 3D-QSAR与FEP联用主动学习对生物等排体进行优先级排序

在线会议 | 3D-QSAR与FEP联用主动学习对生物等排体进行优先级排序

邀请请您参加2025年2月27日北京时间晚10：00的在线会议《用3D-QSAR主动学习FEP对药物化学生物电子等排体进 ...
自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法

自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法

近年来，算力的可用性增加改善了配体-蛋白质相对结合自由能（relative binding free energy，RB ...
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系

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我们展示了一个计算机辅助药物化学设计的练习：使用Activity Atlas1来评估和理解一组CDK2抑制剂的活性特征； ...

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