摘要：在本次的网络研讨会，Lauren Nelson博士将介绍如何高效运用 Cresset 软件 Flare 中的计算方法，为 TYK2 体系中的“新型”配体准确地预测结合自由能。通过展示基准测试结果和盲法生产研究的FEP结果，将向您展示Flare FEP在药物发现项目中快速提供有价值见解的能力，例如我们在本次讨论中的TYK2案例。
日程
- 日期：2025年10月22日，星期三
- 时间：北京时间晚上10点
- 时长：45分钟
- 形式：网络研讨会
- 注册：请点击这里（免费）
内容简介
Liang 等人 (2013) 在其研究中提出了一系列大型同系物配体，用于系统探索 TYK2 活性位点的铰链区和连接臂区。其中第一篇论文报道的 16 个配体已成为评估自由能微扰 (FEP) 预测能力的 TYK2 标准基准数据集。本研究在常规应用基础上进行了拓展，不仅展示了 FEP 在预测未知配体结合亲和力方面的能力，更重要的是提出了对预测结果的分类方法。由于这些化合物源自同一项目并共享 4-氨基吡啶苯甲酰胺母核结构，我们得以利用自身 Flare™ FEP 基准实验中的 TYK2 体系，对额外化合物进行前瞻性计算。本次网络研讨会将介绍如何高效运用 Cresset 软件 Flare 中的计算方法，为 TYK2 体系中的“新型”配体准确预测结合自由能。
本次研讨会涉及的计算方法包括：
- 分子动力学模拟
- 水分析方法3D-RISM
- 用于FEP的配体叠(Conformation Hunt & Align)
- 相对结合自由能(RBFE)微扰理论(Flare FEP)，包括基准模式(针对已知配体)和生产模式(涉及活性未知的配体)。
通过展示基准测试结果和盲法生产研究的FEP结果，将向您展示Flare FEP在药物发现项目中快速提供有价值见解的能力，例如我们在本次讨论中的TYK2案例。
主讲人
Dr. Lauren Nelson, Solutions Scientist
Lauren Nelson博士在纽卡斯尔大学（Newcastle University）完成了计算化学博士学位。她的科学研究专注于量子力学(QM)和分子力学(MM)方法在自由能微扰(FEP)计算中的应用。在此期间，Lauren参与了与北方癌症研究所（Northern Institute of Cancer Research）和爱丁堡大学（ University of Edinburgh）合作的项目。在Cresset公司，Lauren完成了博士后项目，现任解决方案科学家。在目前的职位上，Lauren为Cresset产品创建和提供培训材料，继续从事FEP方法的工作，验证Flare FEP并创建案例研究（包括她在GPCRs方面的工作），并发展她对Cresset提供的基于结构和配体方法的知识。
文献
- Liang J., et al. Lead Optimization of a 4‑Aminopyridine Benzamide Scaffold To Identify Potent, Selective, and Orally Bioavailable TYK2 Inhibitors, J. Med. Chem. 2013, 56, 4521−4536. http://dx.doi.org/10.1021/jm400266t
- Liang J., et al. Lead identification of novel and selective TYK2 inhibitors, European Journal of Medicinal Chemistry, 2013, 67, 175 – 187. http://dx.doi.org/10.1016/j.ejmech.2013.03.070
