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计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您？

本文系统综述了计算化学在药物发现中用于评估配体–蛋白相互作用和优化配体的主要方法。 ...

在缺乏靶标蛋白共晶结构信息的早期药物发现阶段，准确识别配体的生物活性构象对虚拟筛选与先导化合物优化至关重要。 ...

基于形状的虚拟筛选已成为从超大型化合物库中识别结构新颖生物活性分子的有力策略。 ...

氟原子的引入不仅改变了乙烯基片段的静电性质，更可能通过形成 C–F⋯C=O 或 C–F⋯H–C 等弱相互作用，增强配体与 ...

在缺乏靶标蛋白高分辨率晶体结构或已知生物活性构象的情况下，如何准确预测多个结构迥异但功能相似的小分子配体的生物活性构象（ ...

本文总结了Flare 自由能微扰（Flare FEP）技术最近几年的关键进展。 ...

本文介绍了Flare的PLIF聚类分析方法，它可以用来快速识别配体数据集中具有相似结合特征的化合物。 ...

本文介绍了结合模式元动力学（Binding Pose MetaDynamics，BPMD）模拟的开源python实现Op ...

METTL3抑制剂苗头化合物 1 的发现过程综合运用了基于配体的药物设计（LBDD）、结构生物学（SBDD）、QSAR ...

本文提供了一个Flare Python拓展，根据被选择的原子，创建芳香环药效团特征描述，可用来直接替换CDPKit药效团 ...