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网络研讨会 | 简化你的共价抑制剂设计
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云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能
已经有大量的算例表明,Flare FEP可以可靠地预测化合物的结合亲和力。本文演示了如何借助Cloudam云E算力平台j…
原创文章
小墨
Cresset
2020-07-17
1,053
3
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选
本文演示了如何用受体立体碰撞消除(SCAR)法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选:将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
原创文章
小墨
Cresset
2020-03-22
2,325
2
2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构
由上海科技大学饶子和/杨海涛课题组测定的2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶体结构于2020年2…
原创文章
小墨
Cresset
2020-02-06
3,544
4
势能面扫描在Torsion Profile中的应用
降低小分子内能对设计有效的药物至关重要。扭转角特征分析(Torsion profile)围绕可旋转键按一定步长旋转360…
原创文章
小墨
Flare
2020-01-30
2,495
4
Flare™ V3正式发布–包含FEP与新的工作流
FLARE V3正式发布,新特性包括可靠、充分验证的自由能微扰(FEP)计算;多种分子对接(Docking)方式,包括共…
原创文章
小墨
Cresset
2019-11-29
610
0
用静电互补性快速、高效地优化配体-蛋白复合物的结合与选择性
小分子与其受体之间的静电相互作用对于分子识别是必不可少的。理想情况下,蛋白-配体的静电势应最大化其互补性,同时最大限度地…
原创文章
小墨
Cresset
2019-04-04
1,381
0
Flare学者版及其与AutoT&T捆绑特价套餐
Flare是一款基于结构的设计软件,具有用户友好的环境,学术用户可以轻松地开发和测试他们的想法,或插入最有趣的开源算法。…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2019-01-23
1,255
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Flare整合Jupyter
本文演示了如何用内嵌在Flare里的Jupyter Notebook从ChEMBL下载了一组AChE抑制剂、将它们加载到…
原创文章
小墨
Cresset
2019-01-22
1,374
0
FLARE教程 | 如何安装新的Python模块以及进行多元线性回归分析
Flare是一款新颖的基于结构药物设计软件,它的全部功能都可以通过python的API获取。本文演示了(1)如何在Fla…
原创文章
小墨
Cresset
2018-12-26
1,279
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Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算
本文以Flare的WaterSwap计算结合自由能为例,介绍如何利用云计算资源解决突发性大规模的计算需求,内容包括:1)…
原创文章
小墨
Cresset
2018-02-14
2,496
0
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SPARK算例 | 从活性位点里发现新的蛋白-配体相互作用
SPARK V10.6发布:新增分子对接功能与改进搜索算法
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Spruce—高通量生物大分子结构准备
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