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云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能

云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能

已经有大量的算例表明，Flare FEP可以可靠地预测化合物的结合亲和力。本文演示了如何借助Cloudam云E算力平台j…
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构

2019-nCoV 3CL水解酶与抑制剂的复合物结构

由上海科技大学饶子和/杨海涛课题组测定的2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶体结构于2020年2…
势能面扫描在Torsion Profile中的应用

势能面扫描在Torsion Profile中的应用

降低小分子内能对设计有效的药物至关重要。扭转角特征分析(Torsion profile)围绕可旋转键按一定步长旋转360…
Flare™ V3正式发布–包含FEP与新的工作流

Flare™ V3正式发布–包含FEP与新的工作流

FLARE V3正式发布，新特性包括可靠、充分验证的自由能微扰(FEP)计算；多种分子对接(Docking)方式，包括共…
用静电互补性快速、高效地优化配体-蛋白复合物的结合与选择性

用静电互补性快速、高效地优化配体-蛋白复合物的结合与选择性

小分子与其受体之间的静电相互作用对于分子识别是必不可少的。理想情况下，蛋白-配体的静电势应最大化其互补性，同时最大限度地…
Flare学者版及其与AutoT&T捆绑特价套餐

Flare学者版及其与AutoT&T捆绑特价套餐

Flare是一款基于结构的设计软件，具有用户友好的环境，学术用户可以轻松地开发和测试他们的想法，或插入最有趣的开源算法。…
Flare整合Jupyter

Flare整合Jupyter

本文演示了如何用内嵌在Flare里的Jupyter Notebook从ChEMBL下载了一组AChE抑制剂、将它们加载到…
FLARE教程 | 如何安装新的Python模块以及进行多元线性回归分析

FLARE教程 | 如何安装新的Python模块以及进行多元线性回归分析

Flare是一款新颖的基于结构药物设计软件，它的全部功能都可以通过python的API获取。本文演示了（1）如何在Fla…
Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算

Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算

本文以Flare的WaterSwap计算结合自由能为例，介绍如何利用云计算资源解决突发性大规模的计算需求，内容包括：1）…

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