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利用自由能微扰(FEP)预测大环JAK2抑制剂Pacritinib衍生物的结合亲合力
25.05.14
Spark™数据库更新发布并新增农业化学品库
25.05.07
使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
25.04.30
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
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Spark™数据库更新发布并新增农业化学品库
Spark数据库含有来自有商品可供购买的筛选化合物、科技文献、专利文献、商品可供购买的试剂、小分子晶体结构(结晶学开放数 ...
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
在本研究中,来自强生的研究人员利用已知的封帽结构域结合物JNJ-8003进行了一次有针对性的DNA编码库(DEL)筛选, ...
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
METTL3抑制剂苗头化合物 1 的发现过程综合运用了基于配体的药物设计(LBDD)、结构生物学(SBDD)、QSAR ...
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
Cresset技术的核心在于其专有的XED力场,该力场通过扩展电子分布(XED)来更准确地模拟分子内的静电和轨道相互作用 ...
Flare FEP案例 | 在骨架跃迁实验中用绝对结合自由能计算精确预测活性
鉴于计算方法在活性预测方面相比实验室方法的效率优势日益凸显,加之由于计算机硬件的进步,高性能结构赋能方法的可及性不断提高 ...
用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
Cbl-b抑制剂与Tyr363相互作用的TEG片段长期以来都保留了1,2,4-三氮唑结构,直到阿斯利康的Quinn等人采 ...
原创文章
3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
抑制FABP4的小分子可能是治疗代谢综合征的有用候选药物。 ...
原创文章
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
我们展示了一个计算机辅助药物化学设计的练习:使用Activity Atlas1来评估和理解一组CDK2抑制剂的活性特征; ...
原创文章
3D-QSAR与FEP联用主动学习对药物化学生物等排体进行优先级排序
生物等排体替换(Bioisostere replacement)是在药物发现中用于优化候选分子活性和选择性的一个强大且流 ...
原创文章
用SPARK水分子替换实验重现MRTX1719基于片段的发现
在本文中,我们利用计算方法重现了新型合成致死药物MRTX1719的基于片段的发现过程。 ...
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用结合模式元动力学模拟(BPMD)探索配体-蛋白结合模式稳定性
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