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使用Spark™连接臂数据库解决靶向蛋白质降解的连接臂设计挑战

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本文介绍了Spark新发布的具有实验数据支持的、包含已知的和商业可供购买的降解剂连接臂数据库。本文以异双功能降解剂分子A…
Spark™新增连接臂数据库以解决蛋白降解剂连接臂设计的难题

Spark™新增连接臂数据库以解决蛋白降解剂连接臂设计的难题

为了支持靶向蛋白降解（Targeted Protein Degradation，TPD）疗法的研发，Cresset的骨架…
Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间

Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间

2023年1月份，我们发布了SPARK数据库更新，本次发布新增源于专利文献报道的化合物片段库SureChEMBL，大大扩…
用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子，经过分子对接预测结合模式，并用SPARK大环化工作流成功地设计出…
用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计

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SPARK的分子大环化向导是一种快速且易于使用的工作流，可生成有意义且结构多样的计算结果，用于指导大环药物的发现。本文以…
用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式

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在Spark中对新生成的骨架进行聚类可以让您能够根据化学类型对化合物进行分组。这样可以轻松识别分子模式，显示出哪些化合物…
用SPARK™的生物等排体替换来解决代谢稳定性问题

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化合物的代谢稳定性是药物发现和开发的关键因素。由于代谢稳定性差，一些具有良好药理特性的化合物未能成为药物。生物等排体替换…
优化SPARK中的对接路径——在结合位点里直接计算配体-蛋白相互作用来发现新的结果

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用经典的分子对接方法对每个新片段组合的新产物分子进行对接打分将是非常慢而不能用于分子生长。本文详细解释了SPARK是如何…
Spark数据库

Spark数据库

目前发布的Spark数据库来自有商品可供购买的筛选化合物、文献、商品可供购买的试剂、小分子晶体结构（结晶学开放数据库和剑…
SPARK教程 | 分子碎片化创建自己的可搜索数据库

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SPARK是一款生物等排体替换软件，可以实现骨架跃迁、侧链替换、分子生长、分子连接、水分子替换与大环化分子设计等等重要的…

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