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Spark™新增SureChEMBL片段数据库，交付比以往更大的化学空间

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2023年1月份，我们发布了SPARK数据库更新，本次发布新增源于专利文献报道的化合物片段库SureChEMBL，大大扩…
用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

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本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子，经过分子对接预测结合模式，并用SPARK大环化工作流成功地设计出…
用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计

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SPARK的分子大环化向导是一种快速且易于使用的工作流，可生成有意义且结构多样的计算结果，用于指导大环药物的发现。本文以…
用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式

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在Spark中对新生成的骨架进行聚类可以让您能够根据化学类型对化合物进行分组。这样可以轻松识别分子模式，显示出哪些化合物…
用SPARK™的生物等排体替换来解决代谢稳定性问题

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化合物的代谢稳定性是药物发现和开发的关键因素。由于代谢稳定性差，一些具有良好药理特性的化合物未能成为药物。生物等排体替换…
优化SPARK中的对接路径——在结合位点里直接计算配体-蛋白相互作用来发现新的结果

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用经典的分子对接方法对每个新片段组合的新产物分子进行对接打分将是非常慢而不能用于分子生长。本文详细解释了SPARK是如何…
Spark数据库

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目前发布的Spark数据库来自有商品可供购买的筛选化合物、文献、商品可供购买的试剂、小分子晶体结构（结晶学开放数据库和剑…
SPARK教程 | 分子碎片化创建自己的可搜索数据库

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SPARK是一款生物等排体替换软件，可以实现骨架跃迁、侧链替换、分子生长、分子连接、水分子替换与大环化分子设计等等重要的…
SPARK教程 | 如何导入试剂创建自己的可搜索数据库

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SPARK V10.6发布：新增分子对接功能与改进搜索算法

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Spark V10.6是骨架跃迁和生物等排体替换工具SPARK的最新版。它赋能药物化学家和计算化学家们在药物发现项目中使…

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