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优化SPARK中的对接路径——在结合位点里直接计算配体-蛋白相互作用来发现新的结果

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用经典的分子对接方法对每个新片段组合的新产物分子进行对接打分将是非常慢而不能用于分子生长。本文详细解释了SPARK是如何…
Spark数据库

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目前发布的Spark数据库来自有商品可供购买的筛选化合物、文献、商品可供购买的试剂、小分子晶体结构（结晶学开放数据库和剑…
SPARK教程 | 分子碎片化创建自己的可搜索数据库

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SPARK是一款生物等排体替换软件，可以实现骨架跃迁、侧链替换、分子生长、分子连接、水分子替换与大环化分子设计等等重要的…
SPARK教程 | 如何导入试剂创建自己的可搜索数据库

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SPARK V10.6发布：新增分子对接功能与改进搜索算法

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Spark V10.6是骨架跃迁和生物等排体替换工具SPARK的最新版。它赋能药物化学家和计算化学家们在药物发现项目中使…
网络研讨会 | 用SPARK帮你突破现有技术设计的限制（附视频回放）

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本视频演示了如何用SPARK进行骨架跃迁与分子生长以突破现有技术或知识产权的限制、获得具有独立知识产权的新化合物。还演示了即将发布的新版SPARK的特性：用基于结构的方法（分子对接方法）进行分子生长。
用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

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本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物，用SPARK对其进行了基团替换计算实验。结果表明，SPARK在不到1…
SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂

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本文叙述了拜尔公司科研人员用SPARK发现高效、选择性的SOS1抑制剂的研究过程：首先用片段筛选与高通量筛选发现了与SO…
用ADMET Predictor与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程

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以临床药物为先导化合物进行DMPK、结合亲和力与选择性优化是药物发现的一个策略。本文用ADMET Predictor与S…
诺华生物医学研究院用SPARK发现全新的LpxC抑制剂

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诺华生物医学研究院使用骨架跃迁软件Spark对图1化合物6的吲唑母核进行骨架替换以发现代替品。经过对最有希望的、打分靠前…

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