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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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视频 | 药效团模拟——如何在药物发现早期提高虚拟筛选的效率
Thierry Langer教授是维也纳大学药化系主任,他共同开发的Ligandscout是药效团技术的最佳软件。目前使…
原创文章
小墨
Ligandscout
2020-11-09
1,950
1
云计算教程|LigandScout 使用云计算资源加速药效团虚拟筛选
命令行方法使用高性能计算资源阻碍了HPC的可用性,传统的商业软件将计算资源限制于单机方法也限制了用户对高性能计算的利用。…
原创文章
小墨
Ligandscout
2020-09-06
2,276
0
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选
本文演示了如何用受体立体碰撞消除(SCAR)法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选:将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
原创文章
小墨
Cresset
2020-03-22
8,531
3
用卤键替换水分子进行先导化合物结构优化
本文是对黄牛老师课题组水分子的卤键替换策略的实践,重现了论文中的AK算例:从复合物晶体结构(PDB code: 1LII…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-08-15
3,862
1
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现全新DNA促旋酶抑制剂
细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标,为了发现全新的抑制剂,作者采用了两步设计策略:(1)使用LigandScout分…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
2,747
0
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现新的碳酸酐酶VII型抑制剂
哺乳动物碳酸酐酶hCA VII主要表达于大脑并与多个神经生理与疾病相关,其选择性抑制剂可用于治疗癫痫和神经性疼痛。作者借…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
2,322
0
LigandScout案例 | 药效团建模、虚拟筛选及体外测试揭示氟哌啶醇、依普拉酮及芬布酯是神经激肽受体的配体
神经激肽受体参与多种生理过程,是有前景的药物靶标,但是它同时也可能是许多药物副作用的诱因。作者在亚型选择性和非选择性NK…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-09
2,669
1
Ligandscout教程 | 基于片段的虚拟筛选联用AutoT&T进行从头设计
本文演示了如何将Ligandscout的基于片段虚拟筛选与AutoT&T 2联合使用,实现化合物的从头设计。首先用Lig…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2018-08-31
4,496
2
KNIME工作流 | 从ChEMBL数据库提取化合物
本文讲解了如何用KNIME从ChEMBL数据库提取特定靶标的化合物、并对化合物进行初步的数据清洗、多样性分析、构象搜索、…
原创文章
小墨
Cresset
2018-06-03
9,120
3
Ligandscout教程 | 共价键药效团模型与虚拟筛选
本文以EGFR Kinase-Afatinia复合物为例来演示如何用Ligandscout基于结构的方法生成带共价键特征…
原创文章
小墨
Ligandscout
2018-05-15
5,519
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用计算方法研究大环分子的构象预组织——BCL6抑制剂的案例分析
噁拉戈利(Elagolix)阻转异构体的QM扭转角分析
2024-04-30
鸡蛋花素的ECD光谱计算
2024-04-23
Cresset设立新的副总裁职位以领导其人工智能(AI)战略
2024-04-21
分子内硫-孤对电子相互作用
2024-04-14
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