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使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
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SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
25.04.20
增强CDPKit的药效团模型
25.04.18
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
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用Ignite™进行3D虚拟筛选
Ignite是一种新基于配体的虚拟筛选技术,它采用Cresset场技术对给定构象的静电和形状来描述分子,可在组合化学空间 ...
BLAZE云计算——快速地搜索几千万化合物
Blaze用已知配体的形状和静电特性快速地从大型化合物数据库中搜寻到具有相似特性的化合物,让你少花钱却具有极高的生物学筛 ...
ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务
ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算,部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。 ...
OEDocking——信息用的越多,虚拟筛选性能越好
本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接( ...
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估,评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo ...
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对 ...
用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析
人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能,但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有 ...
用BLAZE虚拟筛选11βHSD-1发现结构多样的先导化合物
11βHSD-1在关键代谢组织中高度表达,并与控制内脏脂肪沉积有关。 ...
分子对接后处理——与指定残基发生特定相互作用配体的过滤
分子对接后处理可以提高分子对接虚拟筛选的性能。 ...
片段虚拟筛选发现新的KRAS
G12C
共价抑制剂
在本算例中,我们以6TAM的共晶配体为先导化合物,用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段 ...
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