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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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从肽类与天然产物里发现先导化合物
当你的靶标没有已知的小分子配体、而只有已知的生物大分子与之结合时候该如何设计虚拟筛选策略以发现苗头化合物或先导化合物?本…
原创文章
小墨
BLAZE
2021-04-30
2,546
0
新一代3D药效团模型
3D药效团模型是生物活性构象的配体以化学方式定义的相互作用的三维集合。它以一种优雅的方式来解读化学编码的配体信息,因而在…
原创文章
小墨
Ligandscout
2021-04-17
6,633
3
网络研讨会 | 从肽类与天然产物中发现先导化合物
虚拟筛选是一种非常高效的方法,在药物发现项目中用来识别起始的先导化合物分子或备份系列。明显的优势包括:更高的分子多样性、…
原创文章
小墨
Cresset
2021-03-08
2,172
1
VirtualFlow教程 | Enamine数据库的更新及其虚拟筛选
本文介绍了如何用Virtuaflow虚拟筛选Enamine的Advance、HTS与Real Diverse数据库。
原创文章
小墨
Docking
2020-10-29
6,782
3
云计算教程|LigandScout 使用云计算资源加速药效团虚拟筛选
命令行方法使用高性能计算资源阻碍了HPC的可用性,传统的商业软件将计算资源限制于单机方法也限制了用户对高性能计算的利用。…
原创文章
小墨
Ligandscout
2020-09-06
2,268
0
侧链虚拟筛选:全PDB和ChEMBL数据分析
药物化学的优化通常涉对分子的一部分进行替换设计,其目的是在保留化合物活性的同时提高化合物的其他性能。在本研究中,作者进行…
原创文章
小墨
Cresset
2020-08-02
4,094
2
云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选
VirtualFlow是一款开源的、基于结构的、超高通量虚拟筛选平台,Gorulla等人成功地用8000个核心花两周时间…
原创文章
小墨
Docking
2020-07-20
8,348
8
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选
本文演示了如何用受体立体碰撞消除(SCAR)法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选:将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…
原创文章
小墨
Cresset
2020-03-22
8,508
3
BLAZE案例 | 虚拟筛选发现全新p38 MAPK激酶抑制剂
为了发现全新的p38 MAPK抑制剂,Timothy和同事们使用FieldScreen这一基于配体的虚拟筛选技术,对12…
原创文章
小墨
Cresset
2019-05-10
2,184
0
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现全新DNA促旋酶抑制剂
细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标,为了发现全新的抑制剂,作者采用了两步设计策略:(1)使用LigandScout分…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
2,730
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分子内硫-孤对电子相互作用
2024-04-14
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
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