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用场技术设计新型鞘氨醇激酶1（SK1）抑制剂

用场技术设计新型鞘氨醇激酶1（SK1）抑制剂

在缺乏蛋白-配体复合物结构的情况下，作者通过基于配体的方法FieldTemplater进行基于场的药效团分析以预测已知活…
用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子，经过分子对接预测结合模式，并用SPARK大环化工作流成功地设计出…
用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计

用Spark重现大环HPK1抑制剂的设计

SPARK的分子大环化向导是一种快速且易于使用的工作流，可生成有意义且结构多样的计算结果，用于指导大环药物的发现。本文以…
骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现

骨架跃迁”重现”TYK2 JH2抑制剂NDI-034858的发现

本文以BMS公开的6o化合物为起点，经SPARK进行骨架跃迁、Hit Expander的快速结构修饰，再进一步通过简单结…
识别抗肺结核的新型抑制剂——用活性位点生成InhA还原酶抑制剂的新设计

识别抗肺结核的新型抑制剂——用活性位点生成InhA还原酶抑制剂的新设计

基于片段的药物发现是一个不断发展的研究领域，将苗头化合物转化为先导分子是其独特的挑战。在本案例研究中，我们用生物等排体解…
用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式

用Spark™中的聚类算法识别高排序分子骨架的趋势和模式

在Spark中对新生成的骨架进行聚类可以让您能够根据化学类型对化合物进行分组。这样可以轻松识别分子模式，显示出哪些化合物…
PD-1/PD-L1相互作用抑制剂——探索结合口袋的性质引入新的相互作用

PD-1/PD-L1相互作用抑制剂——探索结合口袋的性质引入新的相互作用

本文以PD-1/PD-L1相互作用抑制剂BMS-202为例，用Flare/GIST与Ligandscout/Apo si…
用SPARK™的生物等排体替换来解决代谢稳定性问题

用SPARK™的生物等排体替换来解决代谢稳定性问题

化合物的代谢稳定性是药物发现和开发的关键因素。由于代谢稳定性差，一些具有良好药理特性的化合物未能成为药物。生物等排体替换…
超越相似性的设计——使用活性位点为您的项目生成新设计

超越相似性的设计——使用活性位点为您的项目生成新设计

在本次在线会议中，我们将演示如何使用 Spark docking来寻找可与活性位点发生相互作用的片段。您将了解到如何在基…
优化SPARK中的对接路径——在结合位点里直接计算配体-蛋白相互作用来发现新的结果

优化SPARK中的对接路径——在结合位点里直接计算配体-蛋白相互作用来发现新的结果

用经典的分子对接方法对每个新片段组合的新产物分子进行对接打分将是非常慢而不能用于分子生长。本文详细解释了SPARK是如何…

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