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用卤键替换水分子进行先导化合物结构优化
本文是对黄牛老师课题组水分子的卤键替换策略的实践,重现了论文中的AK算例:从复合物晶体结构(PDB code: 1LII…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-08-15
3,834
1
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现全新DNA促旋酶抑制剂
细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标,为了发现全新的抑制剂,作者采用了两步设计策略:(1)使用LigandScout分…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
2,722
0
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现新的碳酸酐酶VII型抑制剂
哺乳动物碳酸酐酶hCA VII主要表达于大脑并与多个神经生理与疾病相关,其选择性抑制剂可用于治疗癫痫和神经性疼痛。作者借…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
2,301
0
LigandScout案例 | 药效团建模、虚拟筛选及体外测试揭示氟哌啶醇、依普拉酮及芬布酯是神经激肽受体的配体
神经激肽受体参与多种生理过程,是有前景的药物靶标,但是它同时也可能是许多药物副作用的诱因。作者在亚型选择性和非选择性NK…
原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-09
2,650
1
Ligandscout教程 | 基于片段的虚拟筛选联用AutoT&T进行从头设计
本文演示了如何将Ligandscout的基于片段虚拟筛选与AutoT&T 2联合使用,实现化合物的从头设计。首先用Lig…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2018-08-31
4,471
2
KNIME工作流 | 从ChEMBL数据库提取化合物
本文讲解了如何用KNIME从ChEMBL数据库提取特定靶标的化合物、并对化合物进行初步的数据清洗、多样性分析、构象搜索、…
原创文章
小墨
Cresset
2018-06-03
9,095
3
Ligandscout教程 | 共价键药效团模型与虚拟筛选
本文以EGFR Kinase-Afatinia复合物为例来演示如何用Ligandscout基于结构的方法生成带共价键特征…
原创文章
小墨
Ligandscout
2018-05-15
5,499
4
Ligandscout案例 | 共价键结合药物的虚拟筛选
Schulz R等人(2018 JMC)采用基于结构的方法识别了3C蛋白酶(3C Protease)共价键结合的3D药效…
原创文章
小墨
Ligandscout
2018-05-14
5,728
1
蛋白结构的检查与准备
从PDB数据库下载的蛋白结构并不完美,正确准备与否影响了分子对接的结果。本文介绍了如何在分子对接前检查蛋白的结构,并加以…
原创文章
小墨
Docking
2018-02-20
7,933
7
论文集 | LigandScout药效团技术
本文收集了采用药物设计软件Ligandscout药效团技术发表的文章,包括基于配体的药效团识别、基于结构的药效团识别、虚…
原创文章
小墨
Ligandscout
2017-12-17
3,852
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分子内硫-孤对电子相互作用
2024-04-14
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
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