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云E课堂（12月8日）｜云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能

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本次直播将重点介绍Flare/FEP的特性，并以14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例，演示了如何使用Clou…
FLARE算例 | 炼金术法FEP预测FXR激动剂的结合自由能

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本文以D3R CG2的Free Energy Set 2数据集的14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例，分析了…
云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能

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已经有大量的算例表明，Flare FEP可以可靠地预测化合物的结合亲和力。本文演示了如何借助Cloudam云E算力平台j…
OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能

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在本研究中，作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。首先 使用40个已知EcR配体的验证研究表明，当引入配体的…
FLARE案例 | WaterSwap计算BRD4抑制剂的结合自由能

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本文以几个结构多样的BRD4抑制剂为例，展示了FLARE的WaterSwap模块预测结合自由能的性能。结果表明，Wate…
Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算

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本文以Flare的WaterSwap计算结合自由能为例，介绍如何利用云计算资源解决突发性大规模的计算需求，内容包括：1）…
FLARE教程 | WaterSwap计算结合自由能

FLARE教程 | WaterSwap计算结合自由能

WaterSwap是基于结构设计软件Flare的一个计算模块，专门用来计算配体-蛋白的结合自由能，它可以：1）研究配体结…
Flare V5发布：创新的科技以及基于配体与基于结构方法的协同

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本文介绍了最新版本Flare V5的功能与特性，包括：整合了基于配体的方法Forge；基于结构与基于配体方法的协同使用；…
计算赋能工作流识别全新KRAS<sup>G12C</sup>共价别构抑制剂

计算赋能工作流识别全新KRASG12C共价别构抑制剂

本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…
基于结构药物发现中的决策：对接结果的手工检查

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分子对接是一种广泛应用于药物发现的计算方法。由于分子对接固有的不精确性，结合模式的手工检查是计算药物化学家在决策过程中至…

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