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利用自由能微扰(FEP)预测大环JAK2抑制剂Pacritinib衍生物的结合亲合力
25.05.14
Spark™数据库更新发布并新增农业化学品库
25.05.07
使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
25.04.30
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
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Flare FEP案例 | 在骨架跃迁实验中用绝对结合自由能计算精确预测活性
鉴于计算方法在活性预测方面相比实验室方法的效率优势日益凸显,加之由于计算机硬件的进步,高性能结构赋能方法的可及性不断提高 ...
REINVENT与精确的结合自由能排序相结合的生成式主动学习
主动学习(Active learning,AL)是按顺序连续实验设计的一个具体实例,它使用机器学习来智能地选择下一个要评 ...
原创文章
用Flare FEP计算预测HPK1抑制剂的结合自由能
HPK1作为一种靶标,其特征在于结合口袋具有较高的构象柔性,并涉及到溶剂化作用的影响,这为使用自由能微扰(FEP)方法预 ...
原创文章
数据驱动的微扰网络生成用于相对结合自由能计算
在本文中,Mark为大家解释了FEP计算相对结合自由能的原理,总结了爱丁堡大学Scheen和Michel文章关于AI生成 ...
在线研讨会(视频回放) | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划
本视频介绍了Flare自动确定FEP计算最佳λ的新方法。 ...
云E课堂(12月8日)|云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能
本次直播将重点介绍Flare/FEP的特性,并以14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例,演示了如何使用Clou ...
FLARE算例 | 炼金术法FEP预测FXR激动剂的结合自由能
本文以D3R CG2的Free Energy Set 2数据集的14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例,分析了 ...
云计算教程 | 用FLARE FEP计算相对结合自由能
已经有大量的算例表明,Flare FEP可以可靠地预测化合物的结合亲和力。 ...
OpenEye案例 | 用FreeForm改善MM/PBSA计算结合自由能
在本研究中,作者用MM/PBSA方法预测配体的EcR结合活性。 ...
FLARE案例 | WaterSwap计算BRD4抑制剂的结合自由能
本文以几个结构多样的BRD4抑制剂为例,展示了FLARE的WaterSwap模块预测结合自由能的性能。 ...
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