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用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试

用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试

本文以一对结构相差一个溴原子而活性相差500倍的PTP1B抑制剂为例演示了Flare FEP在北京超级云计算中心GTX …
用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现

用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现

本文以Merck FEP计算基准数据集TNKS2算例中的两个化合物7与5e为例，演示了Flare FEP在速石云计算平台…
自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算

自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算

准确的力场对于可靠地预测小分子的热力学性质至关重要。然而，AMBER GAFF/GAFF2和OpenFF之类的通用可迁移…
在线研讨会（视频回放） | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划

在线研讨会（视频回放） | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划

本视频介绍了Flare自动确定FEP计算最佳λ的新方法。通过预计算获得相空间重叠矩阵可以发现λ值相距太远而无法良好收敛的…
在线研讨会 | 你为什么还自己进行FEP计算呢？FEP计算外包的案例介绍

在线研讨会 | 你为什么还自己进行FEP计算呢？FEP计算外包的案例介绍

自由能微扰 (FEP) 促进配体设计的能力已在最近发表的许多论文和综述中得到广泛证明。该方法的有效实施需要计算化学专业知…
Flare FEP：兼顾速度、精度与易用性，极具竞争力

Flare FEP：兼顾速度、精度与易用性，极具竞争力

本文介绍了最新发布Flare V5中Flare FEP的特性介绍，包括：不影响准确度的情况下近乎1倍的速度提升；自动的中…
网络研讨会｜Flare V5的FEP方法：新的特性与增强

网络研讨会｜Flare V5的FEP方法：新的特性与增强

在早期的药物发现项目中，自由能微扰 (FEP) 技术越来越多地用于待合成及待测试化合物的优先性排序。Flare中的FEP…
云E课堂（12月8日）｜云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能

云E课堂（12月8日）｜云计算加速炼金术法FEP预测结合自由能

本次直播将重点介绍Flare/FEP的特性，并以14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例，演示了如何使用Clou…
网络研讨会｜用FEP配体亲和力的高精度预测来简化分子设计（附视频回放）

网络研讨会｜用FEP配体亲和力的高精度预测来简化分子设计（附视频回放）

配体相对结合亲和力的准确预测在药物发现领域越来越普遍，以帮助确定化合物的合成优先顺序。在此网络研讨会中，我们将简要介绍自由能微扰（FEP）方法，以及确保成功进行模拟所需的先决条件。然后，我们将演示Fl…
FLARE算例 | 炼金术法FEP预测FXR激动剂的结合自由能

FLARE算例 | 炼金术法FEP预测FXR激动剂的结合自由能

本文以D3R CG2的Free Energy Set 2数据集的14个IC50跨度为1000倍的FXR激动剂为例，分析了…

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