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用子图分析识别和解决FEP中预测精度的变化

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子图分析是一种非常有价值的方法，可以提高FEP计算的精度和可靠性，增强其在计算药物发现中的适用性。本文以PTP1B靶标和…
用精确、高效、易用的FEP计算助力重要分子的设计

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本文介绍了Cresset自由能微扰计算解决方案Flare FEP让自由能计算使用平民化的产品设计理念以及为实现这一理念相…
膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力

膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力

本案例研究展示了如何用Flare™ FEP1精确计算结合于P2Y1脂质和GPCR界面之间30个配体的结合亲和力。在本文的…
Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果

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Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台，本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法，包括用大正则非平…
将Flare™ Hit Expander和Flare FEP快速且准确的苗头到先导过程用于CDK9抑制剂的发现

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本案例研究展示了一种联合使用取代位衍生物扫描与自由能计算的工作流，它可以围绕一个苗头化合物来快速探索周围SAR，从而加速…
用云资源加速药物发现——Flare FEP在北京超级云计算中心GPU资源上的性能测试

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本文以一对结构相差一个溴原子而活性相差500倍的PTP1B抑制剂为例演示了Flare FEP在北京超级云计算中心GTX …
用云资源加速药物发现——速石科技GPU资源进行FEP计算的性能表现

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本文以Merck FEP计算基准数据集TNKS2算例中的两个化合物7与5e为例，演示了Flare FEP在速石云计算平台…
自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算

自定义力场进行分子动力学模拟与FEP计算

准确的力场对于可靠地预测小分子的热力学性质至关重要。然而，AMBER GAFF/GAFF2和OpenFF之类的通用可迁移…
在线研讨会（视频回放） | 在FEP结合自由能计算中自动确定最优λ规划

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本视频介绍了Flare自动确定FEP计算最佳λ的新方法。通过预计算获得相空间重叠矩阵可以发现λ值相距太远而无法良好收敛的…
在线研讨会 | 你为什么还自己进行FEP计算呢？FEP计算外包的案例介绍

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自由能微扰 (FEP) 促进配体设计的能力已在最近发表的许多论文和综述中得到广泛证明。该方法的有效实施需要计算化学专业知…

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