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文献重现 | 大环EGFR激酶抑制剂BI-4020的先导化合物5与6的发现与设计

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本文重现了Boehringer Ingelheim的科学家在设计大环EGFR激酶抑制剂BI-4020时先导化合物5与6发…
Gaussian案例 | 嘧啶与炔烃环加成反应的理论设计

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目前大多数计算研究还局限在理解现有的实验现象上，将计算化学作为一个手段，在研究初期提供定量的指导还并不多见，为了探究这种…
可逆Michael受体硫醇加成反应的DFT理论计算

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迈克尔（Michael）受体与半胱氨酸巯基加成是几种共价药物（例如afatinib、osimertinib、ibruti…
AI加持的药物设计是否已成为现实？

AI加持的药物设计是否已成为现实？

人工智能(AI)在药物发现中的应用已成为近年来研究的热点。基于深度学习的生成分子设计是个特别值得关注的领域。 Zavor…
用DFT预测1,4-Michael受体的AMES致突变性

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在不使用动物测试的情况下评估新化学品的安全性是一项非常重要的任务。 AMES试验是一种广泛使用的致突变性生物测定方法，对…
基于片段的方法设计GPCR配体

基于片段的方法设计GPCR配体

G蛋白偶联受体（GPCR）是细胞表面受体的最大家族，可以说是最重要的药物靶标家族。随着X-射线晶体学和冷冻电子显微镜技术…
选择性JAK3抑制剂PF-06651600的设计

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大量致力于JAK激酶抑制剂的发现工作最终将几种化合物推进到临床开发并有两个被FDA批准。尽管在过去20年中付出了巨大的努…
深度学习在药物发现与设计中的应用文献（持续更新）

深度学习在药物发现与设计中的应用文献（持续更新）

本文收集深度学习在药物发现、设计领域的应用，软件（源代码）、学习资源以及科技公司信息等。
结合位点水分子的卤键替换形成有利的相互作用

结合位点水分子的卤键替换形成有利的相互作用

在基于结构的药物设计领域中，蛋白质电负性原子与配体卤素原子之间的卤键相互作用日益受到关注。本文的研究者分析了配体卤原子和…
SPARK案例 | 拜尔发现通过干扰RAS-SOS1相互作用能够阻断RAS激活的SOS1抑制剂

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本文叙述了拜尔公司科研人员用SPARK发现高效、选择性的SOS1抑制剂的研究过程：首先用片段筛选与高通量筛选发现了与SO…

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