药效团

用卤键替换水分子进行先导化合物结构优化

本文是对黄牛老师课题组水分子的卤键替换策略的实践，重现了论文中的AK算例：从复合物晶体结构(PDB code: 1LII ...

细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标，为了发现全新的抑制剂，作者采用了两步设计策略：（1）使用LigandScout分 ...

本文作者Van Drie JH是BioCAD（其产品为Catalyst软件，后来被Accelrys收购）的发起人之一。 ...

Schulz R等人(2018 JMC)采用基于结构的方法识别了3C蛋白酶(3C Protease)共价键结合的3D药效 ...

Ligandscout是一款优秀的药物设计设计软件，提供基于结构的药效团识别、基于配体的药效团识别、高性能构象搜索、虚拟 ...

本文描述了如何用Pymol的CGO绘制球与箭头来表示配体-受体相互作用特征。 ...

晶状体上皮衍生生长因子(LEDGF)或转录共活化因子p75(LEDGF/p75)在HIV整合中起到至关重要的作用。 ...

17β-HSD2是骨质疏松症潜在靶标，可改善雌激素缺乏症的治疗选择。 ...

本文作者用基于配体的策略，从几个已知的17β-HSD2抑制剂用Ligandscout生成基于配体的药效团模型，再用这个模 ...

FieldTemplater是药物设计软件Forge里生成场药效团模型的模块，它以几个活性化合物为输入条件产生药效团模型 ...