虚拟筛选 Archives - 墨灵格的博客

云计算教程|LigandScout 使用云计算资源完成药效团虚拟筛选

命令行方法使用高性能计算资源阻碍了HPC的可用性，传统的商业软件将计算资源限制于单机方法也限制了用户对高性能计算的利用。…

原创文章
小墨
Ligandscout
2020-09-06
184
0

侧链虚拟筛选：全PDB和ChEMBL数据分析

药物化学的优化通常涉对分子的一部分进行替换设计，其目的是在保留化合物活性的同时提高化合物的其他性能。在本研究中，作者进行…

原创文章
小墨
Cresset
2020-08-02
949
2

云计算教程 | 在云端用VirtualFlow实现超高通量虚拟筛选

VirtualFlow是一款开源的、基于结构的、超高通量虚拟筛选平台，Gorulla等人成功地用8000个核心花两周时间…

原创文章
小墨
Docking
2020-07-20
993
3

用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…

原创文章
小墨
Cresset
2020-03-22
1,704
1

广州费米子先导化合物发现服务

广州费米子科技有限责任公司是一家主营药物发现的初创型科技公司。费米子科技的药化团队将其AI团队开发的基于深度学习的虚拟筛…

原创文章
小墨
新闻动态
2020-01-12
779
0

BLAZE案例 | 虚拟筛选发现全新p38 MAPK激酶抑制剂

为了发现全新的p38 MAPK抑制剂，Timothy和同事们使用FieldScreen这一基于配体的虚拟筛选技术，对12…

原创文章
小墨
Cresset
2019-05-10
732
0

LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现全新DNA促旋酶抑制剂

细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标，为了发现全新的抑制剂，作者采用了两步设计策略：（1）使用LigandScout分…

原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
859
0

LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现新的碳酸酐酶VII型抑制剂

哺乳动物碳酸酐酶hCA VII主要表达于大脑并与多个神经生理与疾病相关，其选择性抑制剂可用于治疗癫痫和神经性疼痛。作者借…

原创文章
小墨
Ligandscout
2019-05-10
735
0

认清虚拟筛选中的陷阱

虚拟筛选的目的是利用蛋白质靶标或已知生物活性配体的相关信息通过计算的方法来识别具有活性的化合物。虚拟筛选有众多的参数设置…

原创文章
小墨
文献阅读
2019-01-01
4,342
20

Ligandscout教程 | 基于片段的虚拟筛选联用AutoT&T进行从头设计

本文演示了如何将Ligandscout的基于片段虚拟筛选与AutoT&T 2联合使用，实现化合物的从头设计。首先用Lig…

原创文章
小墨
AutoT&T 2
2018-08-31
1,696
1

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