虚拟筛选 Archives - 墨灵格的博客

BLAZE云计算——快速地搜索几千万化合物

Blaze用已知配体的形状和静电特性快速地从大型化合物数据库中搜寻到具有相似特性的化合物，让你少花钱却具有极高的生物学筛…

小墨
Cresset
2022-04-23
728
0

ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务

ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算，部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。ORION以专有…

小墨
discovery service
2022-04-18
1,263
0

OEDocking——信息用的越多，虚拟筛选性能越好

本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接（…

小墨
OEDocking
2022-04-11
1,388
0

ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估，评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo…

原创文章
小墨
OpenEye
2022-03-15
3,427
0

用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能

本文以PDE5A数据集为例，比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对…

小墨
Docking
2022-03-02
1,779
1

用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析

人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能，但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有…

小墨
Ligandscout
2022-01-25
2,139
1

用BLAZE虚拟筛选11βHSD-1发现结构多样的先导化合物

11βHSD-1在关键代谢组织中高度表达，并与控制内脏脂肪沉积有关。我们的客户要求Cresset的咨询团队以天然配体为起…

小墨
BLAZE
2022-01-02
1,421
1

药效团模型的分层图表示

对于蛋白-配体相互作用模式的研究，目前有各种各样的采样方法允许快速访问大规模数据。主要的例子是大量使用分子动力学模拟应用…

原创文章
小墨
Ligandscout
2021-06-06
1,986
0

Blaze虚拟筛选平台集成Mcule可购买化合物库，为外包项目提供更大的化学多样性

早期小分子发现的合同研究机构Cresset Discovery Services(CDS)与在线化合物库供应商Mcule…

原创文章
小墨
Cresset
2021-05-15
2,013
0

从肽类与天然产物里发现先导化合物

当你的靶标没有已知的小分子配体、而只有已知的生物大分子与之结合时候该如何设计虚拟筛选策略以发现苗头化合物或先导化合物？本…

原创文章
小墨
BLAZE
2021-04-30
1,917
0

BLAZE云计算——快速地搜索几千万化合物

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ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选

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用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析

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Blaze虚拟筛选平台集成Mcule可购买化合物库，为外包项目提供更大的化学多样性

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