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使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
25.04.30
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
25.04.20
增强CDPKit的药效团模型
25.04.18
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
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用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现
本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物,用SPARK对其进行了基团替换计算实验。 ...
用ADMET Predictor与SPARK重现和记黄埔的PI3Kγ/δ双重抑制剂优化的过程
以临床药物为先导化合物进行DMPK、结合亲和力与选择性优化是药物发现的一个策略。 ...
OpenEye案例 | 和记黄埔强效、高选择性的PI3Kγ/δ双重抑制剂
喹唑啉酮是选择性PI3Kγ与PI3Kδ抑制剂的公共片段,在本研究中和记黄埔的科研人员用片段替换软 ...
诺华生物医学研究院用SPARK发现全新的LpxC抑制剂
诺华生物医学研究院使用骨架跃迁软件Spark对图1化合物6的吲唑母核进行骨架替换以发现代替品。 ...
AutoT&T 2.0-高效的药物分子从头设计软件
AutoT&T(Automatic Tailoring and Transplanting)是一款具有我国自主知识产权的 ...
SPARK教程 | 共价结合抑制剂的骨架跃迁
本文以EGFR激酶共价抑制剂Afatinib为例,描述了如何用SPARK的共价药效团特征进行共价抑制剂弹头的结构替换(跃 ...
案例 | 骨架跃迁发现发现新型选择性LSD1抑制剂(JMC2017)
本文分享了Mould等人如何从高通量筛选发现苗头化合物、再用骨架跃迁进行苗头化合物的优化、结合文献信息进一步修饰化合物与 ...
案例 | 骨架跃迁优化选择性可逆性LSD1抑制剂(BMCL2017)
现有LSD1可逆抑制剂GSK-690同时也是hERG抑制剂,这限制了该类化合物的开发。 ...
教程 | SPARK替换结晶水分子
如何利用复合物晶体结构的水分子信息,从一个活性很弱的起始化合物出发,经过片段替换(骨架跃迁、侧链替换)大幅提高化合物的活 ...
BLAZE案例 | 基于场的虚拟筛选与生物等排体替换发现和优化新型小分子HIV-1进入抑制剂
目前HIV治疗方案产生了大量耐药株和累积毒性,因此迫切需要发展抑制HIV-1复制的新型药物。 ...
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