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将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例

将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例

本文介绍了两个将水与静电分析作为基于结构设计核心的应用案例。一个算例来自TYK2 JH2抑制剂，GamePlan的取代假…

原创文章
小墨
OpenEye
2022-12-29
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用水的能量学信息重现KRAS<sup>G12D</sup>选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程

用水的能量学信息重现KRAS^G12D选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程

本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构（PDB 7RT4）结合位点进行水…

小墨
OpenEye
2022-05-16
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KRAS<sup>G12C</sup>共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换

KRAS^G12C共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换

本文以KRAS共价抑制剂MRTX849的先导化合物优化为例，说明水分子替换策略在先导化合物优化过程中的重要性。与经典的分…

小墨
Cresset
2021-08-30
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水分子替换导致BTK抑制剂活性下降100多倍的理论解释

水分子替换导致BTK抑制剂活性下降100多倍的理论解释

本文介绍了OpenEye SZMAP计算水分子位置及其热力学性质的原理，还介绍了水-中性水探针自由能差(n_ddG)的概…

小墨
OpenEye
2021-08-02
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双水记——水分子替换而活性降低的理论解释

双水记——水分子替换而活性降低的理论解释

2012年辉瑞公司的Trujillo等人在 “双水记（a tale of two waters）”一文描述了对hH-PG…

原创文章
小墨
Flare
2021-07-25
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SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用

SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用

本文对SZMAP计算的水能量学指标进行了总结，重点介绍了SZMAP稳定化自由能与中性水探针自由能差的概念、区别及其应用。…

原创文章
小墨
OpenEye
2017-06-15
3,649
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