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Flare V10发布——新增绝对自由能微扰、蛋白-蛋白对接、蛋白-配体相互作用指纹等功能
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用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
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将水与静电分析作为基于结构设计的核心——BCL6与TYK2 JH2抑制剂算例
本文介绍了两个将水与静电分析作为基于结构设计核心的应用案例。 ...
用水的能量学信息重现KRAS
G12D
选择性抑制剂MRTX1133的哌嗪侧链优化过程
本文演示了如何用SZMAP/GAMEPLAN对KRAS G12D-化合物5B的共晶结构(PDB 7RT4)结合位点进行水 ...
KRAS
G12C
共价抑制剂MRTX849先导化合物优化过程中的水分子替换
本文以KRAS共价抑制剂MRTX849的先导化合物优化为例,说明水分子替换策略在先导化合物优化过程中的重要性。 ...
水分子替换导致BTK抑制剂活性下降100多倍的理论解释
本文介绍了OpenEye SZMAP计算水分子位置及其热力学性质的原理,还介绍了水-中性水探针自由能差(n_ddG)的概 ...
双水记——水分子替换而活性降低的理论解释
2012年辉瑞公司的Trujillo等人在 “双水记(a tale of two waters)”一文描述了对hH-PG ...
SZMAP | 水分子的稳定化自由能计算及其应用
本文对SZMAP计算的水能量学指标进行了总结,重点介绍了SZMAP稳定化自由能与中性水探针自由能差的概念、区别及其应用。 ...
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