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用XED场技术与SQM分析分子间硫-氧/氮孤对电子相互作用
除了在硫与氮/氧孤对电子之间发生有利的相互作用之外,在硫原子与氧或氮原子的孤对电子之间还可能发生对结合不利的排斥相互作用 ...
噁拉戈利(Elagolix)阻转异构体的QM扭转角分析
本文介绍了阻转异构体的概念,并以抗痛经药物噁拉戈利(Elagolix)为例,演示了如何用Flare QM对模型分子进行扭 ...
用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在 ...
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。 ...
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构 ...
用Flare QM计算化合物的ECD图谱
Flare V6的一个新特性是引入了配体QM计算。 ...
培训通知 | 用QM/MM模拟酶与底物的反应
培训通知:以组蛋白甲基转移酶为例,本课程将采用分子动力学模拟、QM/MM计算、拉伸动力学模拟、伞形采样等方法模拟甲基从辅 ...
Flare V10发布——新增绝对自由能微扰、蛋白-蛋白对接、蛋白-配体相互作用指纹等功能
Flare V10发布,新版Flare为计算化学和药物化学带来了新增和增强的科学功能。 ...
选择性CDK7抑制剂SY-5609的大环化设计
Flare,由Cresset公司研发的综合性药物设计软件,在最新版本V9中集成了Spark模块,后者是一个基于片段的分子 ...
原创文章
用ORCA计算VCD图谱进行绝对构型的指认
本文以Fenchol及其对映异构体Alt-Fenchol为例,演示了如何用ORCA计算其VCD图谱,并用Cai Fact ...
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