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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序

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本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算，包括下面步骤：对化合物进行穷尽构象搜索、在…
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性

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在本文中，我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析，绘制扭转角-激酶活性图。结…
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应

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GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法，确认了一对仅一个价键差异的分子，其20多倍的生物活性差异是由构…
用Flare QM计算化合物的ECD图谱

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Flare V6的一个新特性是引入了配体QM计算。本文以(S)-Dexmedetomidine为例介绍了如何通过Flar…
QM扭转角分析在药物化学中的应用

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降低小分子内能对设计有效的药物至关重要。扭转角特征分析(Torsion profile)围绕可旋转键按一定步长旋转360…
培训通知 | 用QM/MM模拟酶与底物的反应

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培训通知：以组蛋白甲基转移酶为例，本课程将采用分子动力学模拟、QM/MM计算、拉伸动力学模拟、伞形采样等方法模拟甲基从辅…
鸡蛋花素的ECD光谱计算

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本文以(+)-鸡蛋花素的绝对构型确证为例介绍了如何通过Flare 构象搜索与Flare QM进行ECD光谱计算，具体步骤…
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  • 2024-04-23
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分子内硫-孤对电子相互作用

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本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例，分别用GNINA分子对接与Flare QM…
用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象

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本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例，模拟了结合模式完美、打分…
锁定生物活性构象增强活性

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本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好，复现了从化合物…

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