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基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

深度生成模型已用来进行从头分子设计，能够生成性质理想的化合物。然而，大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用

KRAS抑制剂MRTX849骨架跃迁引入新的相互作用

本文详述了如何以MTRX849系列化合物为起始分子，以docking为打分函数，用Spark虚拟筛选VeryCommon…
从活性位点里发现新的蛋白-配体相互作用

从活性位点里发现新的蛋白-配体相互作用

1H-吲唑-3-甲酰胺类化合物1是全新的ATP-竞争性GSK-3β抑制剂，它具有良好的激酶选择性、PK特性和药效，但其h…
Gaussian案例 | 实验及DFT理论计算揭示硬盘驱动器无磁性Ni-P膜的p型掺杂机制

Gaussian案例 | 实验及DFT理论计算揭示硬盘驱动器无磁性Ni-P膜的p型掺杂机制

本研究将密度泛函理论(DFT)计算与电化学阻抗谱(EIS)测试相结合，提出了镍团簇催化次磷酸氧化还原的新机理。DFT计算…
基于片段的方法设计GPCR配体

基于片段的方法设计GPCR配体

G蛋白偶联受体（GPCR）是细胞表面受体的最大家族，可以说是最重要的药物靶标家族。随着X-射线晶体学和冷冻电子显微镜技术…
OpenEye案例 | 和记黄埔强效、高选择性的PI3Kγ/δ双重抑制剂

OpenEye案例 | 和记黄埔强效、高选择性的PI3Kγ/δ双重抑制剂

喹唑啉酮是选择性PI3Kγ与PI3Kδ抑制剂的公共片段，在本研究中和记黄埔的科研人员用片段替换软…
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现全新DNA促旋酶抑制剂

LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现全新DNA促旋酶抑制剂

细菌DNA促旋酶是一种新型抗菌药的靶标，为了发现全新的抑制剂，作者采用了两步设计策略：（1）使用LigandScout分…
LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现新的碳酸酐酶VII型抑制剂

LigandScout案例 | 基于结构的虚拟筛选发现新的碳酸酐酶VII型抑制剂

哺乳动物碳酸酐酶hCA VII主要表达于大脑并与多个神经生理与疾病相关，其选择性抑制剂可用于治疗癫痫和神经性疼痛。作者借…
Lead Finder 分子对接性能测试

Lead Finder 分子对接性能测试

本文用CASF-2013数据集测试了Lead Finder的采样性能与打分性能。结果表明：重复进行3次计算，取打分最高前…
Ligandscout案例 | 共价键结合药物的虚拟筛选

Ligandscout案例 | 共价键结合药物的虚拟筛选

Schulz R等人(2018 JMC)采用基于结构的方法识别了3C蛋白酶(3C Protease)共价键结合的3D药效…

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