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SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
25.04.20
增强CDPKit的药效团模型
25.04.18
计算药物发现工具——对发现过程的深入理解
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ORION云计算——OEDocking与ROCS超高通量虚拟筛选计算服务
ORION是OpenEye基于AWS的云计算计算,部署了OpenEye的全部软件工具并整合多种开源软件。 ...
OEDocking——信息用的越多,虚拟筛选性能越好
本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接( ...
ROCS——用形状技术进行高效的虚拟筛选
本文用DUDE数据集对基于配体的ROCS虚拟筛选方法进行了性能评估,评估指标包括总体性能ROC AUC、早期富集能力lo ...
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对 ...
用张力能评估构象稳定性及其在先导化合物优化中的应用——更多力场选择
本文用两对化学结构仅一个原子差异但活性相差巨大的分子对为例,尝试用FreeForm以不同的力场计算张力能来解释活性差异的 ...
用OEChem分析Asciminib与ABL的相互作用
OEChem不仅是一个强大的数据整合工具,而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。 ...
用OEChem解决键级与电荷问题
在本文中,演示了如何读入一个SDF分子结构,用Vina将其docking到一个蛋白结合位点里,然后试图将对接结果用模板法 ...
用OEChem分析Abemaciclib与CDK6的相互作用
OEChem不仅是一个强大的数据整合工具,而且还是强大的蛋白-配体相互作用分析工具。 ...
OEChem数据处理从圣诞快乐开始
OEChem是OpenEye强大的化学信息学工具,可在各种数据整合场景中用于处理各种来源的生物、化学的数据,结构准备以及 ...
综合利用基于结构与基于配体的方法理解SD抑制剂的SAR
小柱孢酮脱水酶(Scytalone Dehydratase,SD)抑制剂可以保护水稻免受稻瘟病菌引起的病害。 ...
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