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25.06.02
利用自由能微扰(FEP)预测大环JAK2抑制剂Pacritinib衍生物的结合亲合力
25.05.14
Spark™数据库更新发布并新增农业化学品库
25.05.07
使用蛋白质-配体相互作用指纹(PLIF)对分子数据进行聚类
25.04.30
SPARK应用案例——RSV聚合酶抑制剂从DEL苗头到类药先导化合物的优化
25.04.22
选择性METTL3抑制剂EP652苗头化合物1的发现
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使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计
本文演示了如何利用Flare水分析工具3D-RISM用来分析大环抑制剂BRD-810与靶标的共晶结构、理解大环的结合模式 ...
原创文章
基于GIST的水合位点分析及其在基于结构设计中的应用
本文详细介绍了Flare GIST水分析原理,以及如何进行基于GIST的水合位点分析。 ...
PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计
本文用Flare GIST分析了PDE10A的apo结合位点,用计算的水合位点与水合自由能解释了苗头化物与先导化合物优化 ...
QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨
在本文中,我们用QPCT/SEN177的共晶结构PDB 6GBX作为QPCTL/SEN177结合模型的代理,回溯性地重现 ...
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。 ...
基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能
本文以DUD-E的NRAM为子集为例,演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进 ...
了解水在蛋白-配体复合物中的作用以及在药物发现中何时需要考虑水
Cresset不仅提供药物设计软件,而且有专门的团队提供药物发现服务。 ...
SHP2别构抑制剂TNO155发现过程回顾与基于结构的SAR分析
NO155是诺华开发的First-In-Class选择性、可口服的SHP2别构抑制剂,具有理想的成药性值,是首个进入临床 ...
水分子替换导致BTK抑制剂活性下降100多倍的理论解释
本文介绍了OpenEye SZMAP计算水分子位置及其热力学性质的原理,还介绍了水-中性水探针自由能差(n_ddG)的概 ...
双水记——水分子替换而活性降低的理论解释
辉瑞的Trujillo等人在 “双水记(a tale of two waters)”一文描述了对hH-PGDS结合口袋的 ...
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用结合模式元动力学模拟(BPMD)探索配体-蛋白结合模式稳定性
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