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使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

使用Flare™水分析3D-RISM在大环抑制剂BRD-810结合位点进行探索、准备与药物设计

本文演示了如何利用Flare水分析工具3D-RISM用来分析大环抑制剂BRD-810与靶标的共晶结构、理解大环的结合模式 ...

原创文章

基于GIST的水合位点分析及其在基于结构设计中的应用

基于GIST的水合位点分析及其在基于结构设计中的应用

本文详细介绍了Flare GIST水分析原理，以及如何进行基于GIST的水合位点分析。 ...

PDE10A抑制剂MK-8189苗头到先导、先导优化中的水分子置换设计

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本文用Flare GIST分析了PDE10A的apo结合位点，用计算的水合位点与水合自由能解释了苗头化物与先导化合物优化 ...

QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨

QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨

在本文中，我们用QPCT/SEN177的共晶结构PDB 6GBX作为QPCTL/SEN177结合模型的代理，用GIST方 ...

从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计

从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计

本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。 ...

基于结构的过滤提高分子对接虚拟筛选的富集性能

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本文以DUD-E的NRAM为子集为例，演示了如何用Flare的相互作用分析对Lead Finder分子对接虚拟筛选结果进 ...

了解水在蛋白-配体复合物中的作用以及在药物发现中何时需要考虑水

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Cresset不仅提供药物设计软件，而且有专门的团队提供药物发现服务。 ...

SHP2别构抑制剂TNO155发现过程回顾与基于结构的SAR分析

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NO155是诺华开发的First-In-Class选择性、可口服的SHP2别构抑制剂，具有理想的成药性值，是首个进入临床 ...

水分子替换导致BTK抑制剂活性下降100多倍的理论解释

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本文介绍了OpenEye SZMAP计算水分子位置及其热力学性质的原理，还介绍了水-中性水探针自由能差(n_ddG)的概 ...