通过一个热门的疟疾靶标,阐述了独特的3D Cresset场技术比常用2D指纹相似性方法的优势,并举例说明了BLAZE虚拟…
PROTAC连接臂的设计与评估
在这个实验中,我们使用Spark对已知的PROTAC PEG连接臂进行了生物等排体替换,以寻找新的、令人感兴趣的连接臂。…
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- Cresset
- 2024-03-21
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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
Flare FEP在3个GPCR基准测靶标A2A、OX2和P2Y1体系上取得了最先进的性能,进一步验证了其适用于具有挑战…
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- Cresset
- 2024-03-21
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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在…
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- Conformational control
- 2024-03-20
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QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。结…
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- conformational design
- 2024-03-18
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用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分…
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- conformational design
- 2024-03-13
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基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
纤维蛋白聚集是神经退行性疾病的特征,但也是难以进行配体设计的代表性靶标,因为关于结合位点的结构信息有限。在本文中,用基于…
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- Cresset
- 2024-03-09
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用QSAR模型对新设计的分子进行优先级排序——SARS-CoV-2 Mpro抑制剂的2D与3D-QSAR研究
本文用一个包含76个SARS-COV-2 Mpro抑制剂的数据集为例,演示了Cresset Discovery团队如何利…
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- 3D-QSAR
- 2024-03-07
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在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构…
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- Conformational control
- 2024-03-03
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锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物…
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- Conformational control
- 2024-02-15
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QPCTL抑制剂SEN177的骨架跃迁及结合模式探讨
在本文中,我们用QPCT/SEN177的共晶结构PDB 6GBX作为QPCTL/SEN177结合模型的代理,用GIST方…
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- Cresset
- 2024-02-03
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