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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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文章标签 "结合亲和力"
关于分子对接预测结合模式的问题
本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例,解释为什么分子对接并不是一件容易的事。
原创文章
小墨
Docking
2021-07-30
5,392
4
如何用静电互补性打分
静电互补性打分(EC Score)的基本思想是:当配体和受体的静电势匹配时(即具有相同的量值和相反的符号),实现配体和受…
原创文章
小墨
Cresset
2019-05-01
3,439
1
关于用分子对接预测结合亲和力的问题
人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽:对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…
原创文章
小墨
Docking
2019-04-30
17,519
7
用静电互补性快速、高效地优化配体-蛋白复合物的结合与选择性
小分子与其受体之间的静电相互作用对于分子识别是必不可少的。理想情况下,蛋白-配体的静电势应最大化其互补性,同时最大限度地…
原创文章
小墨
Cresset
2019-04-04
4,420
0
Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算
本文以Flare的WaterSwap计算结合自由能为例,介绍如何利用云计算资源解决突发性大规模的计算需求,内容包括:1)…
原创文章
小墨
Cresset
2018-02-14
4,567
0
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2024-04-23
鸡蛋花素的ECD光谱计算
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2024-04-21
分子内硫-孤对电子相互作用
2024-04-14
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
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