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文章标签 "结构准备"
使用Flare的组合库枚举器(Library enumerator)进行化学修饰
在基于配体和基于结构设计方法中,配体的互变异构体和质子化状态的正确归属对于分子建模实验的成功是至关重要的,因为它可能对配…
原创文章
小墨
Cresset
2023-06-02
666
0
关于分子对接预测结合模式的问题
本文以Imatinib、dasatinib与ABL1激酶复合物结合模式为例,解释为什么分子对接并不是一件容易的事。
原创文章
小墨
Docking
2021-07-30
5,207
4
Spruce—高通量生物大分子结构准备
spruce是一款高精度蛋白结构准备软件,以便下游的应用软件使用。下游的应用包括:基团替换软件BROOD,分子对接软件F…
原创文章
小墨
OpenEye
2021-01-20
2,529
1
OpenEye | 化合物数据库的准备
为了对大型数据库进行搜索以发现潜在的活性化合物,需要对数据库进行合理的准备。本文系统论述了小分子数据库结构准备需要考虑的…
原创文章
小墨
OpenEye
2020-09-09
5,635
1
蛋白结构的检查与准备
从PDB数据库下载的蛋白结构并不完美,正确准备与否影响了分子对接的结果。本文介绍了如何在分子对接前检查蛋白的结构,并加以…
原创文章
小墨
Docking
2018-02-20
7,676
7
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在PROTAC设计中使用静电互补性
2024-03-21
PROTAC连接臂的设计与评估
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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
2024-03-20
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