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用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计
本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子,经过分子对接预测结合模式,并用SPARK大环化工作流成功地设计出…
原创文章
小墨
Cresset
2023-02-26
2,253
0
AutoT&T算例——DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现
本文以DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现为例,演示了如何用Flare分子对接与AutoT&T的裁剪、移植策略相…
小墨
AutoT&T 2
2021-11-29
2,731
1
JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植
本文以JAK3共价抑制剂PF-06651600为例,演示了如何用Ligandscout的药效团片段筛选方法对片段数据库进…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-28
2,413
1
片段虚拟筛选发现新的KRAS
G12C
共价抑制剂
在本算例中,我们以6TAM的共晶配体为先导化合物,用LigandScout基于结构的方法识别药效团并搜索ZINC双环片段…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2021-06-22
2,787
0
基于片段的方法设计GPCR配体
G蛋白偶联受体(GPCR)是细胞表面受体的最大家族,可以说是最重要的药物靶标家族。随着X-射线晶体学和冷冻电子显微镜技术…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2019-12-01
3,957
1
Flare学者版及其与AutoT&T捆绑特价套餐
Flare是一款基于结构的设计软件,具有用户友好的环境,学术用户可以轻松地开发和测试他们的想法,或插入最有趣的开源算法。…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2019-01-23
3,081
0
AutoT&T 2.0算例 | VEGFR-2抑制剂的多起点优化
VEGFR-2是非常重要的抗肿瘤靶标,本文以结构多样的12个VEGFR-2抑制剂做为多起点优化的参比分子,演示了Auto…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2018-09-05
3,352
0
Ligandscout教程 | 基于片段的虚拟筛选联用AutoT&T进行从头设计
本文演示了如何将Ligandscout的基于片段虚拟筛选与AutoT&T 2联合使用,实现化合物的从头设计。首先用Lig…
原创文章
小墨
AutoT&T 2
2018-08-31
4,340
2
AutoT&T 2.0-高效的药物分子从头设计软件
AutoT&T(Automatic Tailoring and Transplanting)是一款具有我国自主知识产权的…
原创文章
小墨
基于结构的设计
2018-08-23
4,467
0
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QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
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基于配体的虚拟筛选发现高亲和力淀粉样蛋白配体
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用QSAR模型对新设计的分子进行优先级排序——SARS-CoV-2 M
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在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
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