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24.03.21
使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
24.01.26
2024年Cresset用户会(UGM2024)
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Flare V8新特性介绍
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在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
23.12.10
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文章标签 "binding affinity"
配体熵很难但不应被忽略
如果采取适当的措施,对接预测的结合模式和亲和力是可以精确计算的。在柔性配体结合时,因构象自由度限制导致的结合能熵惩罚在计…
原创文章
小墨
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2024-03-30
401
0
如何用静电互补性打分
静电互补性打分(EC Score)的基本思想是:当配体和受体的静电势匹配时(即具有相同的量值和相反的符号),实现配体和受…
原创文章
小墨
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2019-05-01
3,431
1
关于用分子对接预测结合亲和力的问题
人们喜欢用分子对接预测化合物的结合亲和力以解释化合物的活性差异。经常有人吐槽:对接对化合物活性排序非常不准。因此本文的主…
原创文章
小墨
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2019-04-30
17,399
7
用静电互补性快速、高效地优化配体-蛋白复合物的结合与选择性
小分子与其受体之间的静电相互作用对于分子识别是必不可少的。理想情况下,蛋白-配体的静电势应最大化其互补性,同时最大限度地…
原创文章
小墨
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2019-04-04
4,404
0
Flare教程 | WaterSwap-如何整合公有云加速结合自由能的计算
本文以Flare的WaterSwap计算结合自由能为例,介绍如何利用云计算资源解决突发性大规模的计算需求,内容包括:1)…
原创文章
小墨
Cresset
2018-02-14
4,559
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2024-04-14
分子内硫-孤对电子相互作用
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
配体熵很难但不应被忽略
2024-03-30
基于结构虚拟筛选的科学与艺术
2024-03-28
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