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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
24.01.26
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Flare V8新特性介绍
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在线会议 | 计算结合于磷脂/膜界面P2Y1 GPCR配体的结合亲和力
23.12.10
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文章标签 "deep generative model"
选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁
本文以Merck的选择性CDK8抑制剂MSC2530818的衍生物为起点分子,用SPARK对连接臂部分进行了生物等排体替…
原创文章
小墨
Cresset
2023-05-04
1,925
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用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计
本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子,经过分子对接预测结合模式,并用SPARK大环化工作流成功地设计出…
原创文章
小墨
Cresset
2023-02-26
2,326
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AutoT&T算例——DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现
本文以DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现为例,演示了如何用Flare分子对接与AutoT&T的裁剪、移植策略相…
小墨
AutoT&T 2
2021-11-29
2,797
1
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总
深度生成模型已用来进行从头分子设计,能够生成性质理想的化合物。然而,大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
原创文章
小墨
案例
2021-07-21
2,866
0
使用深度生成模型设计具有所需药效团的DDR1抑制剂
本文描述了如何联合使用LigandScout与REINVENT实现深度生成模型 (DGM) 设计具有所需药效团的DDR1…
原创文章
小墨
Ligandscout
2021-07-03
2,724
0
用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现
本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物,用SPARK对其进行了基团替换计算实验。结果表明,SPARK在不到1…
原创文章
小墨
Cresset
2019-09-05
4,710
4
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2024-04-14
分子内硫-孤对电子相互作用
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
避免虚拟筛选时的化学类型偏好——用3D静电场与形状描述符来探索多样的化学空间
2024-04-03
配体熵很难但不应被忽略
2024-03-30
基于结构虚拟筛选的科学与艺术
2024-03-28
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