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选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁

选择性CDK8抑制剂的骨架跃迁

本文以Merck的选择性CDK8抑制剂MSC2530818的衍生物为起点分子，用SPARK对连接臂部分进行了生物等排体替…

原创文章
小墨
Cresset
2023-05-04
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用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

用SPARK重现选择性大环CDK2抑制剂QR-6401的设计

本文以一个“线型”的CDK2抑制剂化合物13为起点分子，经过分子对接预测结合模式，并用SPARK大环化工作流成功地设计出…

原创文章
小墨
Cresset
2023-02-26
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AutoT&T算例——DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现

AutoT&T算例——DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现

本文以DDR1抑制剂从苗头化合物到先导化合物的发现为例，演示了如何用Flare分子对接与AutoT&T的裁剪、移植策略相…

小墨
AutoT&T 2
2021-11-29
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基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

深度生成模型已用来进行从头分子设计，能够生成性质理想的化合物。然而，大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…

原创文章
小墨
案例
2021-07-21
2,055
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使用深度生成模型设计具有所需药效团的DDR1抑制剂

使用深度生成模型设计具有所需药效团的DDR1抑制剂

本文描述了如何联合使用LigandScout与REINVENT实现深度生成模型 (DGM) 设计具有所需药效团的DDR1…

原创文章
小墨
Ligandscout
2021-07-03
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用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

用SPARK基团替换策略重现深度学习DDR1抑制剂的发现

本文以DDR1抑制剂Ponatinib为起始化合物，用SPARK对其进行了基团替换计算实验。结果表明，SPARK在不到1…

原创文章
小墨
Cresset
2019-09-05
4,157
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