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Flare V10发布——新增绝对自由能微扰、蛋白-蛋白对接、蛋白-配体相互作用指纹等功能
25.01.22
用SPARK生物等排体替换加速胺基甲酸酯 Cbl-b 抑制剂的发现
25.01.16
自适应Lambda调度——一种提高自由能微扰模拟计算效率的方法
25.01.15
3D-QSAR与Spark生物等排体替换联合使用——高效骨架跃迁设计新型FABP4抑制剂
25.01.11
药物化学设计的核心问题——Forge和Spark之间的协同关系
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警惕虚拟筛选性能测试的结论——选择合理的蛋白结构来提高富集性能
本文以DUD-E的靶标HIV PR为例,演示了蛋白结构选择对虚拟筛选性能的影响。 ...
OEDocking——信息用的越多,虚拟筛选性能越好
本文用DUDE+数据集对OEDocking使用单一apo结构的FRED分子对接、单一holo结构的HYBRID分子对接( ...
用多个蛋白信息来提高用单一蛋白结构分子对接虚拟筛选的性能
本文以PDE5A数据集为例,比较了使用单一apo结构的FRED分子对接虚拟筛选与使用多个holo结构的HYBRID分子对 ...
用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析
人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能,但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有 ...
如何进行虚拟筛选的方法学验证
本文主要讨论了如何评价虚拟筛选方法的性能,如何绘制ROC曲线、计算命中率、富集因子(EF)、ROC曲线下面积(ROC A ...
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