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使用Flare™ FEP进行精确结合亲和力的计算——三个GPCR基准测试结果令人鼓舞
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文章标签 "Flare QM"
噁拉戈利(Elagolix)阻转异构体的QM扭转角分析
本文介绍了阻转异构体的概念,并以抗痛经药物噁拉戈利(Elagolix)为例,演示了如何用Flare QM对模型分子进行扭…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-04-30
130
0
鸡蛋花素的ECD光谱计算
本文以(+)-鸡蛋花素的绝对构型确证为例介绍了如何通过Flare 构象搜索与Flare QM进行ECD光谱计算,具体步骤…
原创文章
小墨
qm
2024-04-23
235
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分子内硫-孤对电子相互作用
本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例,分别用GNINA分子对接与Flare QM…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-04-14
426
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用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-20
370
0
QM扭转角分析——控制依鲁替尼芳香轴构象提高靶标选择性
在本文中,我们用Flare QM对Ibrutinib及其构象控制的衍生物进行了QM扭转角分析,绘制扭转角-激酶活性图。结…
原创文章
小墨
conformational design
2024-03-18
271
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用扭转角分析解释完美的结合模式、实测活性令人失望的现象
本文用一对结合构象稳定、结合模式一致、分子对接打分区分不开活性的BAZ2A/B抑制剂5、7为例,模拟了结合模式完美、打分…
原创文章
小墨
conformational design
2024-03-13
975
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在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-03-03
636
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锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物…
原创文章
小墨
Conformational control
2024-02-15
481
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通过扭转角分析发现先导化合物优化的机会
本文演示了如何用Flare QM的扭转角分析以发现高能的生物学构象并由此发现化合物优化的机会。具体地讲,以BMS Fac…
原创文章
小墨
Cresset
2023-11-25
903
0
从构象稳定性与水分子替换角度理解PARP1抑制剂HRS1167的设计
本文用Flare的QM计算与GIST水能量学计算分析了Parp1抑制剂HRS1167大环化设计。HRS1167的大环设计…
原创文章
小墨
Cresset
2023-11-23
519
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2024-04-14
虚拟筛选——从CB1结合剂中筛选出对CB2具有选择性的先导化合物
2024-04-10
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