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PD-1/PD-L1相互作用抑制剂——探索结合口袋的性质引入新的相互作用

PD-1/PD-L1相互作用抑制剂——探索结合口袋的性质引入新的相互作用

本文以PD-1/PD-L1相互作用抑制剂BMS-202为例，用Flare/GIST与Ligandscout/Apo si…
用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析

用系综虚拟筛选策略提高基于药效团模型的虚拟筛选性能——PDE5A抑制剂虚拟筛选案例分析

人们已经证明系综虚拟筛选策略可以提高基于配体与基于分子对接虚拟筛选方法的性能，但能否提高基于药效团虚拟筛选方法的性却没有…
基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

基于药效团、分子对接、分子形状的深度增强学习结构生成案例汇总

深度生成模型已用来进行从头分子设计，能够生成性质理想的化合物。然而，大部分深度生成模型的性质并不包含比如形状、药效团以及…
JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植

JAK3共价抑制剂激酶铰链区结合片段的虚拟筛选、裁剪与移植

本文以JAK3共价抑制剂PF-06651600为例，演示了如何用Ligandscout的药效团片段筛选方法对片段数据库进…
计算赋能工作流识别全新KRAS<sup>G12C</sup>共价别构抑制剂

计算赋能工作流识别全新KRASG12C共价别构抑制剂

本文用Ilib Diverse重现了拜尔公司Mortier等人的计算赋能工作流识别全新KRAS G12C共价抑制剂中的组…
被高引用的论文是如何产生的？

被高引用的论文是如何产生的？

为庆祝2020年JCIM创刊60周年推出虚拟专刊，遴选出过去60年间在药物设计和化学信息学领域最具影响力的10篇论文，包…
视频 | 药效团模拟——如何在药物发现早期提高虚拟筛选的效率

视频 | 药效团模拟——如何在药物发现早期提高虚拟筛选的效率

Thierry Langer教授是维也纳大学药化系主任，他共同开发的Ligandscout是药效团技术的最佳软件。目前使…
教程 | ZINC数据库的下载

教程 | ZINC数据库的下载

ZINC数据库是一个已经进行过系列准备、并生成高质量3D构象的小分子化合物数据库，可以直接用于分子对接等虚拟筛选。本文描…
云计算教程|LigandScout 使用云计算资源加速药效团虚拟筛选

云计算教程|LigandScout 使用云计算资源加速药效团虚拟筛选

命令行方法使用高性能计算资源阻碍了HPC的可用性，传统的商业软件将计算资源限制于单机方法也限制了用户对高性能计算的利用。…
用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

用常规分子对接进行共价抑制剂的虚拟筛选

本文演示了如何用受体立体碰撞消除（SCAR）法进行共价抑制剂的分子对接虚拟筛选：将常规分子对接虚拟筛选与Ligandsc…

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