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膜蛋白的自由能微扰计算——用Flare FEP精确地计算暴露于脂质与GPCR P2Y1界面上配体的结合亲合力

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本案例研究展示了如何用Flare™ FEP1精确计算结合于P2Y1脂质和GPCR界面之间30个配体的结合亲和力。在本文的…
在Flare™中用RDKit指纹与2D描述符建立QSAR模型

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在本文中，我们演示了如何用Flare的QSAR建模功能，导入RDKit指纹与2D分子描述符用于机器学习方法SVM建立血脑…
Flare™系综共价对接

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系综共价对接（Ensemble Covalent Docking）是Flare最近引入的一个新功能。本文以脯氨酰寡肽酶（…
在Flare里创建肽类分子

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在本文中，我们介绍了Flare肽编辑器的功能。具体地讲，我们以人工非糖甜味剂天冬氨酸苯丙氨酸二肽的甲酯（阿斯巴甜）为例，…
使用Flare的组合库枚举器（Library enumerator）进行化学修饰

使用Flare的组合库枚举器（Library enumerator）进行化学修饰

在基于配体和基于结构设计方法中，配体的互变异构体和质子化状态的正确归属对于分子建模实验的成功是至关重要的，因为它可能对配…
Flare™V7.0发布——增强的分子对接、更好的QSAR建模与更精确的FEP与MD结果

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Flare是Cresset基于配体和基于结构的建模平台，本文介绍了最新版本V7全新的、增强的科学和方法，包括用大正则非平…
利用Flare™中的分子动力学模拟深入了解膜蛋白复合物

利用Flare™中的分子动力学模拟深入了解膜蛋白复合物

本文介绍了Flare MD模拟对膜蛋白模拟支持的一些特性。
将Flare™ Hit Expander和Flare FEP快速且准确的苗头到先导过程用于CDK9抑制剂的发现

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本案例研究展示了一种联合使用取代位衍生物扫描与自由能计算的工作流，它可以围绕一个苗头化合物来快速探索周围SAR，从而加速…
用Flare Python API实现根据配体叠合来调整蛋白的取向

用Flare Python API实现根据配体叠合来调整蛋白的取向

对药化科研人员和计算化学专家来说，在3D可视化工具中摆放蛋白结构是一个简单且必要的操作，用于蛋白-配体结合位点的叠合、与…
用Pyflare来简化苗头化合物的识别

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Pyflare是一个专用的python二进制文件，可以从命令行python脚本中访问Flare的全部功能。这使得诸如对接…

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