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用FieldTemplater预测ROS1抑制剂的生物活性构象
25.09.30
在线会议 | 自由能微扰(FEP)研究——识别“新型”TYK2配体
25.09.27
在缺乏靶标结构信息的情况下解析多种DPPIV配体的结合模式
25.09.13
FEP与3D-QSAR相结合的主动学习范式分析
25.08.31
在线会议 | 人工智能重塑药物发现
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查寻分子的准备对基于形状虚拟筛选的影响
基于形状的虚拟筛选已成为从超大型化合物库中识别结构新颖生物活性分子的有力策略。 ...
计算大环ALK抑制剂的全局构象张力能
本文以大环ALK抑制剂Lorlatinib发现过程中活性差异20倍的一个分子对为例,演示了它们的构象张力能计算以评估其结 ...
用计算构象预组织对大环CDK2抑制剂设计进行优先级排序
在本文中,我们用计算构象预组织(conformational pre-organization)分析了活性跨度为2个数量 ...
用计算方法研究大环分子的构象预组织——BCL6抑制剂的案例分析
本文介绍了构象预组织概念、理论计算方法及其在药物设计中的应用。 ...
噁拉戈利(Elagolix)阻转异构体的QM扭转角分析
本文介绍了阻转异构体的概念,并以抗痛经药物噁拉戈利(Elagolix)为例,演示了如何用Flare QM对模型分子进行扭 ...
分子内硫-孤对电子相互作用
本文以一对结构仅一个原子差异但活性有65倍差异的Factor Xa抑制剂为例,分别用GNINA分子对接与Flare QM ...
用QM构象张力能来对多样的生物等排体母核进行优先级排序
本文介绍一个基于Flare QM的工作流来对不同母核化合物进行构象张力能计算,包括下面步骤:对化合物进行穷尽构象搜索、在 ...
在基于结构的设计中用QM扭转角分析研究构象效应
GSK的Senger等人结合结构生物学与量子化学计算方法,确认了一对仅一个价键差异的分子,其20多倍的生物活性差异是由构 ...
锁定生物活性构象增强活性
本文以HNE抑制剂为例来演示如何用Flare QM的Torsion Profile来评估化合物构象能偏好,复现了从化合物 ...
势能面——联系分子结构与能量的纽带
本文介绍了势能面与反应坐标的概念,以及势能面与结构、能量的关系。还讨论了结构、稳定性、反应性和选择性与能量之间的关系。 ...
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